底薪1000元是否违法，需结合具体情况判断，但通常情况下，若该底薪低于当地最低工资标准，则属于违法行为。以下从不同角度进行分析：
最低工资标准的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
- 最低工资标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报国务院备案。因此，不同地区的最低工资标准可能不同。
- 如果底薪1000元低于当地最低工资标准，那么用人单位的行为就违反了法律规定，劳动者有权要求用人单位补足差额，并可能依法要求用人单位支付赔偿金。
劳动合同的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十条，劳动者在试用期的工资不得低于本单位相同岗位最低档工资或者劳动合同约定工资的百分之八十，并不得低于用人单位所在地的最低工资标准。
- 如果底薪1000元是试用期工资，且低于当地最低工资标准或本单位相同岗位最低档工资的百分之八十，那么同样属于违法行为。
- 对于非试用期工资，如果劳动合同中明确约定了底薪为1000元，但这一约定违反了最低工资标准的规定，那么该约定也是无效的。
实际操作与法律后果的角度：
- 在实际操作中，如果劳动者发现自己的底薪低于当地最低工资标准，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 劳动监察部门或劳动仲裁机构会依法进行调查和处理，如果确认用人单位存在违法行为，会责令用人单位补足差额、支付赔偿金，并可能对用人单位进行罚款等行政处罚。
建议：
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资的约定，确保自己的工资不低于当地最低工资标准。
- 如果发现用人单位支付的工资低于最低工资标准，应及时向用人单位提出异议，并保留好相关证据（如工资条、劳动合同等），以便在需要时维护自己的合法权益。
- 有问题可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供更详细的法律建议。