公司辞退员工并扣除补偿金，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁来处理结果。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议仲裁是解决劳动争议的一种法定方式。当员工与公司之间因辞退、补偿金等问题发生争议时，员工有权向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，以维护自己的合法权益。
二、处理流程
准备仲裁申请：
- 员工需要准备仲裁申请书，明确自己的仲裁请求（如要求公司支付被扣除的补偿金、支付违法辞退的赔偿金等）、事实和理由。
- 提交相关证据材料，如劳动合同、辞退通知、工资单、补偿金扣除证明等，以支持自己的仲裁请求。
提交仲裁申请：
- 员工应将仲裁申请书和相关证据材料提交给公司所在地的劳动争议仲裁委员会。
- 仲裁委员会在收到申请后，会进行审查，并在一定期限内决定是否受理。
仲裁审理：
- 如果仲裁委员会决定受理，会安排开庭审理。在审理过程中，双方可以陈述自己的观点和证据，进行辩论。
- 仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定，作出裁决。
执行裁决：
- 如果仲裁委员会裁决公司应支付被扣除的补偿金或其他赔偿，公司应在规定期限内履行裁决。
- 如果公司不履行裁决，员工可以向人民法院申请强制执行。
三、可能的结果与建议
如果仲裁裁决支持员工：
- 公司应按照裁决结果支付被扣除的补偿金或其他赔偿。
- 如果公司不履行，员工可以申请强制执行，以维护自己的合法权益。
如果仲裁裁决不支持员工：
- 员工可以仔细审查裁决书，了解裁决的理由和依据。
- 如果员工认为裁决有误，可以在规定期限内向人民法院提起诉讼，寻求司法救济。
建议：
- 在提起仲裁申请前，员工应尽可能收集相关证据材料，以支持自己的仲裁请求。
- 在仲裁过程中，员工应积极配合仲裁委员会的工作，如实陈述事实和提供证据。
- 如果员工对仲裁结果不满意，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并考虑是否提起诉讼。
四、注意事项
- 员工在提起仲裁申请时，应注意仲裁时效的问题。根据法律规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
- 员工在仲裁过程中应保持冷静和理性，避免情绪化行为影响仲裁结果。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。