卫生院在编人员与单位发生纠纷，是可以申请劳动仲裁的，但具体情形需结合在编人员的身份性质及纠纷内容来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、在编人员身份性质对劳动仲裁的影响
事业编制人员：
- 如果你作为卫生院的在编人员，拥有的是事业编制，那么你与卫生院之间的关系通常被视为人事关系，而非单纯的劳动关系。不过，这并不意味着你不能通过劳动仲裁来解决纠纷。
- 根据《劳动争议调解仲裁法》及相关规定，事业编制人员与单位之间因履行聘用合同发生的争议，虽然可能更侧重于通过人事争议仲裁或诉讼途径解决，但在某些情况下，如涉及工资、福利等劳动权益的争议，也可以参照劳动争议的处理方式，即申请劳动仲裁。但具体还需看地方性法规或政策是否有特别规定。
非事业编制但签订劳动合同的人员：
- 如果你虽然是在编人员，但与卫生院签订的是劳动合同，而非聘用合同，那么你与卫生院之间的关系就是典型的劳动关系。
- 在这种情况下，你完全有权根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，以解决与卫生院之间的纠纷。
二、纠纷内容对劳动仲裁的适用性
劳动权益纠纷：
- 无论你是事业编制人员还是非事业编制人员，只要纠纷内容涉及你的劳动权益，如工资、福利、工作时间、休息休假、社会保险等，你都可以考虑申请劳动仲裁。
- 劳动仲裁是解决劳动权益纠纷的一种有效方式，它具有程序简便、效率较高、成本较低等优点。
人事关系纠纷：
- 如果纠纷主要涉及的是人事关系方面的问题，如职称评定、岗位调整、解聘辞退等，那么可能更适合通过人事争议仲裁或诉讼途径来解决。
- 但这并不意味着完全不能申请劳动仲裁，具体还需看纠纷的具体内容和地方性法规或政策的规定。
三、申请劳动仲裁的流程与注意事项
准备材料：
- 在申请劳动仲裁前，你需要准备好相关证据材料，如劳动合同、工资单、工作证、考勤记录等，以证明你与卫生院之间存在劳动关系以及纠纷的具体情况。
提交申请：
- 你需要向卫生院所在地的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并按照要求填写相关信息和提交证据材料。
参与仲裁程序：
- 在仲裁过程中，你需要积极参与，如实陈述事实，提供证据，并遵守仲裁庭的纪律和规定。
执行仲裁裁决：
- 如果仲裁裁决对你有利，但卫生院不履行裁决义务，你可以向人民法院申请强制执行。
建议：在申请劳动仲裁前，你可以先尝试与卫生院进行协商解决纠纷，以节省时间和成本。如果协商无果，再考虑申请劳动仲裁。同时，你也可以咨询当地劳动争议仲裁委员会或法律援助机构的工作人员，以获取更具体的指导和帮助。
如果你在申请劳动仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。