企业申请不定时工作制，确实需要和员工进行商量，并达成一致意见。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，不定时工作制是针对因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。然而，这并不意味着企业可以单方面决定实施不定时工作制。企业在申请不定时工作制时，必须与工会或职工代表进行协商，并达成一致意见。这是保障职工合法权益、确保工时制度合法合规的重要环节。

协商过程的重要性

1. 保障职工权益：通过协商，职工可以了解不定时工作制的具体内容、实施方式以及可能带来的影响，从而做出合理的判断和选择。这有助于保障职工的休息权、劳动报酬权等合法权益。
2. 增强企业合规性：协商过程也是企业展示其合规经营、尊重职工权益的重要机会。通过与职工或工会进行充分沟通，企业可以确保不定时工作制的实施符合法律法规要求，避免因违规操作而引发的法律风险。
3. 促进劳动关系和谐：协商过程有助于增进企业与职工之间的理解和信任，促进劳动关系的和谐稳定。当职工感受到企业的尊重和关怀时，他们更可能积极配合企业的管理，共同推动企业的发展。

实际操作建议

1. 提前沟通：企业在申请不定时工作制前，应提前与职工或工会进行沟通，说明实施不定时工作制的必要性、可行性以及可能带来的影响。这有助于为后续的协商过程打下良好的基础。
2. 充分协商：在协商过程中，企业应充分听取职工或工会的意见和建议，对不定时工作制的具体内容进行反复讨论和修改，直至达成一致意见。这有助于确保不定时工作制的实施符合双方的利益和需求。
3. 签订协议：协商达成一致意见后，企业应与职工签订书面协议，明确不定时工作制的具体内容、实施方式、劳动报酬等事项。这有助于保障双方的权益，避免后续因理解不一致而引发的纠纷。

可能的法律后果

如果企业未经与职工或工会协商，单方面决定实施不定时工作制，可能面临以下法律后果：

1. 劳动争议：职工可能因此与企业产生劳动争议，要求企业支付加班费、赔偿金等费用。
2. 行政处罚：劳动行政部门可能对企业进行行政处罚，如责令改正、罚款等。
3. 声誉损害：企业的违规行为可能损害其声誉和形象，影响企业的长期发展。

综上所述，企业在申请不定时工作制时，必须与职工或工会进行充分协商，并达成一致意见。这是保障职工权益、确保企业合规经营、促进劳动关系和谐的重要举措。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。