结论：在合同纠纷中，若原告提供的录音资料被告不确认是其本人的声音，一般由提出异议的一方（即被告）申请鉴定，而鉴定费用原则上由申请方（被告）预交，最终根据鉴定结果由责任方承担。以下从不同角度详细分析：
一、谁申请鉴定
在民事诉讼中，当一方提供证据（如录音资料）而另一方对其真实性提出异议时，通常由提出异议的一方承担举证责任，即需要证明该证据不真实或存在瑕疵。因此，在本案中，若被告不确认录音资料中的声音是其本人的，那么被告有责任申请鉴定以证明其主张。如果被告不申请鉴定，而法院又认为该录音资料对案件事实的查明有重要影响，法院也可能会依职权委托鉴定，但这种情况相对较少。
二、鉴定费用谁负担
预交费用：鉴定费用一般由申请鉴定的一方（即被告）预交。这是因为鉴定是被告为了证明其主张而提出的，因此被告需要承担初步的举证责任，包括预交鉴定费用。
最终负担：鉴定费用的最终负担则取决于鉴定结果。如果鉴定结果证明录音资料中的声音确实不是被告的，那么鉴定费用应由原告承担，因为原告提供的证据被证明不真实，导致被告产生了不必要的鉴定费用。反之，如果鉴定结果证明录音资料中的声音是被告的，那么鉴定费用应由被告承担，因为被告的异议被证明不成立。
特殊情况：在某些特殊情况下，如双方对鉴定结果均有争议，或者法院认为鉴定费用的负担与案件事实的查明有直接关系等，法院可能会根据案件的具体情况，酌情决定鉴定费用的负担方式。
三、实际操作建议
保留证据：在申请鉴定前，双方应尽可能保留好与案件相关的所有证据，包括录音资料的原始载体、通话记录等，以便在鉴定过程中提供给鉴定机构进行比对和分析。
及时沟通：在诉讼过程中，双方应保持及时沟通，就鉴定事宜达成一致意见。如果双方对鉴定机构的选择、鉴定费用的负担等存在争议，可以及时向法院提出申请，由法院进行裁决。
遵守法律程序：在申请鉴定和承担鉴定费用的过程中，双方应严格遵守法律程序和相关规定，确保鉴定结果的公正性和合法性。
最后，合同纠纷中的证据鉴定和费用负担问题可能因案件具体情况而有所不同。如果你在实际操作中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。