结论：仲裁劳动关系不通过，并不意味着不能申请用工主体责任，但具体能否申请以及申请的途径，需根据实际情况和法律规定来确定。

详细分析：

1. 用工主体责任与劳动关系的区别：

   • 用工主体责任主要关注的是用人单位在用工过程中应承担的法律责任，如支付劳动报酬、提供劳动条件、保障劳动安全等。这种责任并不完全依赖于劳动关系的存在，即使劳动关系未被确认，用人单位在某些情况下仍可能需承担用工主体责任。
   • 劳动关系则是劳动者与用人单位之间基于劳动合同而产生的法律关系，它涉及双方的权利和义务，是认定工伤、享受社会保险待遇等的前提。

2. 仲裁劳动关系不通过的影响：

   • 如果仲裁机构未确认劳动关系，这通常意味着劳动者与用人单位之间不存在基于劳动合同的法律关系。但这并不排除用人单位在其他方面（如用工主体责任）可能需承担的法律责任。
   • 仲裁不通过可能只是针对劳动关系的确认，而不涉及用工主体责任的其他方面。因此，劳动者仍有可能根据具体情况申请用人单位承担用工主体责任。

3. 申请用工主体责任的途径：

   • 协商：如果用人单位和劳动者对于用工主体责任的认定没有太大争议，双方可以优先选择自行协商，就责任承担、补偿赔偿等问题达成一致意见。
   • 劳动仲裁：虽然仲裁劳动关系不通过，但如果用工主体责任争议属于劳动仲裁的范畴（如涉及劳动报酬、工伤医疗费等），劳动者仍可以向劳动仲裁机构申请仲裁。劳动仲裁机构会根据双方提交的证据和法律规定对用工主体责任进行认定，并作出裁决。
   • 诉讼：如果劳动者对仲裁结果不服，或者用工主体责任争议不属于劳动仲裁的范畴，劳动者可以向人民法院提起诉讼，由法院来认定用工主体责任并作出判决。

4. 实际操作建议：

   • 在处理此类问题时，劳动者应首先收集相关证据，如工作证、工资单、工作记录等，以证明自己与用人单位之间存在用工关系。
   • 根据具体情况和争议的性质，选择合适的解决途径。如果争议较小且双方愿意协商，可以优先选择协商解决；如果争议较大或协商无果，可以考虑申请劳动仲裁或提起诉讼。

法律背景与建议：

• 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，劳动仲裁机构负责处理因确认劳动关系、劳动报酬、工伤医疗费等发生的争议。因此，即使劳动关系未被确认，如果用工主体责任争议属于这些范畴之一，劳动者仍可以申请劳动仲裁。
• 在申请用工主体责任时，劳动者应注意保留和收集相关证据，以支持自己的主张。同时，也应了解相关法律法规和程序要求，以便更好地维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果劳动者成功申请用工主体责任并得到支持，用人单位可能需要承担相应的法律责任，如支付劳动报酬、赔偿损失等。
• 如果劳动者未能成功申请用工主体责任或申请被驳回，劳动者可能需要根据具体情况考虑其他救济途径或接受不利后果。

总之，仲裁劳动关系不通过并不意味着不能申请用工主体责任。劳动者应根据实际情况和法律规定来选择合适的解决途径，并收集相关证据以支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。