结论：员工签署了工资已结清的证明但公司未实际发放工资，员工仍有权要求公司支付工资，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 法律背景：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是用人单位的法定义务，不因员工签署任何文件而免除。
   • 员工签署的“工资已结清”证明，若实际上工资并未结清，该证明并不具有法律效力，因为它违背了事实真相，且可能是在公司胁迫或误导下签署的。

2. 员工权益：

   • 员工有权要求公司按照实际工作情况支付工资，包括基本工资、奖金、津贴等所有应得收入。
   • 若公司拒绝支付，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，甚至通过诉讼途径来维护自己的合法权益。

3. 法律建议：

   • 收集证据：员工应首先收集与工资支付相关的证据，如工资条、银行转账记录、工作记录、与公司的沟通记录等，以证明公司未实际支付工资。
   • 与公司协商：在掌握充分证据的基础上，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司支付拖欠的工资。
   • 申请劳动仲裁：若协商无果，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，提交相关证据和仲裁申请书，要求公司支付工资及可能的经济补偿。
   • 提起诉讼：若对劳动仲裁结果不满，员工还可以向法院提起诉讼，通过司法程序来维护自己的权益。

4. 可能后果：

   • 若公司被认定存在拖欠工资的行为，除了需要支付拖欠的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
   • 在极端情况下，若公司行为构成恶意拖欠工资，还可能涉及刑事责任，但这种情况相对较少见。

进一步行动建议：

• 员工在采取任何行动前，应确保自己已充分了解相关法律法规和程序，必要时可寻求专业法律人士的帮助。
• 在与公司的沟通过程中，员工应保持冷静和理性，避免情绪化行为，以免影响自己的权益维护。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。