工厂上班旷工扣钱是否合法，需分情况讨论：
有合法规章制度且扣款合理：
- 规章制度合法性：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，工厂有权通过民主程序制定规章制度，对旷工等违纪行为进行处理，包括扣减工资。但规章制度必须经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定，且需公示或告知劳动者。
- 扣款合理性：扣减工资的数额必须合理，应与劳动者旷工所造成的实际损失相匹配。例如，按照旷工当天实际未出勤的时间和对应的工资进行扣除通常较为合理。若规定旷工一天扣三天工资等明显不合理的处罚措施，可能因显失公平而不被法律认可。
无合法规章制度或扣款不合理：
- 无规章制度：若工厂没有合法的规章制度规定旷工扣款事宜，则不能随意扣减劳动者工资。
- 扣款超过法定限制：根据《工资支付暂行规定》第十六条，即使工厂有相关规章制度规定旷工扣工资，每月扣除的部分也不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。例如，某地区月最低工资标准为2000元，员工月工资为5000元，若旷工扣款超过1000元（即5000元的20%），则超出部分不合法。
劳动者权益保护：
- 协商解决：若劳动者认为工厂扣减工资的行为不合法，可先与工厂协商解决。
- 投诉与仲裁：协商不成时，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 规章制度合法性审查：如规章制度存在违法情形，如过于严苛的罚款或扣款措施、违反最低工资标准等，劳动者有权向劳动监察部门投诉举报。
实例说明：
假设某工厂员工小李月工资为4000元，当地月最低工资标准为1800元。若小李旷工一天，工厂根据合法规章制度规定扣除其旷工当天工资（假设为200元），则合法。但若工厂规定旷工一天扣500元，则超出部分（300元）不合法，因为扣除后小李的剩余工资（3500元）虽高于最低工资标准，但单日扣款超过了其日工资的合理范围（通常日工资为月工资除以21.75天，即约184元），且若按此逻辑每月旷工多天则可能很快超过月工资20%的限制。更合理的做法是，若旷工未造成直接经济损失，仅扣除当天未出勤的工资；若造成损失，则按实际损失扣除，但同样需遵守每月扣除不超过20%及剩余工资不低于最低工资标准的规定。
总结与建议：
工厂在制定旷工扣钱的相关规定时，应确保规定的合理性、合法性，并严格遵守相关法律法规的限制。同时，劳动者也应了解自己的权益和义务，在遇到不合法扣减工资的情况时，积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。