关于工厂旷工罚款是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要依据具体的法律法规以及工厂的规章制度来综合判断。
首先，从法律层面来看：
在我国，自2008年国务院废止《企业职工奖惩条例》后，法律并未再直接赋予用人单位对劳动者进行罚款的权力。罚款，作为一种行政处罚权，主要由具有行政处罚权的行政机关来实施。因此，从直接的法律依据上来说，工厂直接对员工进行罚款是缺乏明确上位法支持的。
然而，这并不意味着工厂完全无法对旷工行为进行管理：
工厂可以通过制定合法、合规的规章制度来对旷工行为进行约束。这些规章制度在制定时，必须满足以下条件：
内容合法：规章制度中的旷工罚款条款不得违反法律、法规的强制性规定。罚款金额应当合理，不能过高或过低，且应与员工旷工给工厂造成的实际损失相匹配。
程序民主：规章制度的制定应当经过职工代表大会或者全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。这是确保规章制度合法性和合理性的重要环节。
公示告知：工厂应当将制定的规章制度进行公示或告知员工，确保员工了解并遵守相关规定。公示方式可以包括员工手册发放、规章制度培训、公告栏张贴等。
如果工厂的规章制度满足上述条件，那么在一定限度内对旷工员工进行罚款是可能的：
但即便如此，工厂也应当谨慎行使这一权力，因为罚款并非唯一的管理手段。工厂还可以考虑采取其他合法、合理的管理措施，如：
扣减相应工资：根据《工资支付暂行规定》，对于员工缺勤的情况，工厂可以不支付缺勤期间的工资。但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
解除劳动合同：如果工厂的规章制度明确规定旷工达到一定天数属于严重违反用人单位规章制度，并且该规章制度已经过民主程序制定且向员工公示或告知，那么工厂可以依据《劳动合同法》的规定，以员工严重违反用人单位规章制度为由解除劳动合同。
最后，需要强调的是：
如果工厂违反法律规定或规章制度对员工进行不合理罚款，员工有权与企业协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。同时，工厂也应加强内部管理，确保规章制度的合法性和合理性，以避免不必要的法律纠纷。
综上所述，工厂旷工罚款的合法性并非绝对，而是取决于工厂规章制度的合法性和合规性。在处理旷工问题时，工厂应严格遵守法律法规和规章制度的要求，采取合法、合理的管理措施来维护工厂的正常运营秩序和员工的合法权益。