结论：工作12小时但吃饭时间仅30分钟是否合法，需结合具体的工作制度、行业特点以及是否支付了加班费等因素来综合判断。在大多数情况下，如果这种工作安排违反了关于工作时间和休息休假的法律规定，且未支付相应的加班费，那么这种安排是不合法的。
分析：
法律规定的工作时间：
- 根据《劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果因特殊原因需要延长工作时间，每日不得超过3小时，每月不得超过36小时。
- 在您描述的情况下，工作12小时显然超过了法定的每日工作时间上限，即使扣除30分钟的吃饭时间，也仍然超出了正常的工作时间范围。
休息与用餐时间：
- 劳动者在工作期间应享有合理的休息和用餐时间。虽然法律没有明确规定具体的用餐时间长度，但30分钟的用餐时间在连续工作12小时的情况下显然是不合理的，这可能影响到劳动者的身体健康和工作效率。
加班费支付：
- 如果因工作需要延长工作时间，用人单位应支付加班费。在您描述的情况下，如果工作12小时是常态，且用人单位未支付加班费，那么这种安排不仅违反了工作时间的规定，也违反了加班费支付的规定。
特殊行业与岗位：
- 需要注意的是，某些特殊行业或岗位（如医疗、交通、能源等）可能因工作性质的需要而实行特殊的工作制度。然而，即使在这些行业或岗位中，也应确保劳动者的休息和用餐时间，并支付相应的加班费。
建议：
- 如果您正面临这种情况，首先建议与用人单位沟通，了解工作安排的具体原因和依据，并要求用人单位遵守相关法律规定，合理安排工作时间和支付加班费。
- 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，寻求帮助和支持。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理。
- 在必要时，您也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
后续行动：
- 在采取任何行动之前，建议您先收集相关证据，如工作记录、工资单、与用人单位的沟通记录等，以证明您的权益受到了侵害。
- 如果您对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到有效维护，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。