关于请假超过三个月工资如何计算的问题，这需要结合请假类型、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断，以下分情况为你详细说明：
- 病假
- 法律依据：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，企业应当按照规定支付病假工资或者疾病救济费。
- 工资计算：病假工资可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80％。具体计算方式可能因地区而异，例如有些地区规定，连续工龄不满2年的，按本人工资的60％计发；连续工龄满2年不满4年的，按本人工资的70％计发等。如果医疗期超过三个月，只要在法定医疗期内，依然按照上述标准支付工资。
- 事假
- 法律依据：事假通常是企业根据自身情况自行规定的，法律并没有对事假期间的工资支付做出强制性规定。
- 工资计算：一般情况下，企业有权不支付事假期间的工资。如果员工请假超过三个月属于事假，企业可以按照内部规章制度，不发放这三个月的工资。不过，企业规章制度应当经过民主程序制定并公示，否则可能对员工不产生约束力。
- 带薪年休假、婚假、产假等法定假期
- 带薪年休假：根据《职工带薪年休假条例》，职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。在带薪年休假期间，职工享受与正常工作期间相同的工资收入。如果员工一次性休完超过三个月的带薪年休假（这种情况比较特殊，一般年休假天数较少），企业应当按照正常工资标准支付工资。
- 婚假：婚假天数根据地区不同而有所差异，一般在1 - 30天不等。在婚假期间，企业应当按照劳动合同规定的工资标准支付工资。
- 产假：根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天；难产的，增加产假15天；生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，增加产假15天。各地还根据实际情况出台了延长产假的规定。在产假期间，企业应当按照女职工原工资标准支付工资，或者按照生育保险的相关规定支付生育津贴。
如果公司没有按照上述规定支付工资，你可以先与公司协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁。如果你还有其他关于工资计算或者劳动权益方面的问题，欢迎随时向我咨询。