在公司和下属项目部同时领取两份工资是否违法，需分情况讨论：
若两份工资均基于合法劳动关系，且未违反公司规定与税法规定
- 劳动关系合法性：如果员工与公司以及下属项目部之间均建立了合法的劳动关系，并且这两份工作都是员工实际提供的劳动所对应的报酬，那么从劳动法的角度来看，员工领取两份工资本身并不直接构成违法。但前提是，这种双重劳动关系必须得到所有相关雇主的明确同意或默许，且不违反任何一方的公司规章制度或劳动合同中的排他性条款。
- 税法规定：员工需要确保两份工资都按照税法规定进行了个人所得税的申报和缴纳。如果未依法纳税，则可能面临税务违法的问题。
若领取两份工资的行为违反公司规定、劳动合同或税法规定
- 违反公司规定或劳动合同：如果公司或下属项目部的规章制度、劳动合同中明确规定了员工不得在其他单位兼职或领取额外工资，而员工仍然这么做，那么这种行为就违反了公司规定或劳动合同，公司有权依据相关规定对员工进行处理，包括但不限于警告、罚款、解除劳动合同等。
- 违反税法规定：如果员工未依法对两份工资进行个人所得税的申报和缴纳，或者通过虚假申报等方式逃避税收，那么这种行为就构成了税务违法，可能面临税务机关的处罚，包括补缴税款、滞纳金、罚款等，甚至可能涉及刑事责任。
法律建议：
- 审查合同与规定：在考虑领取两份工资之前，员工应仔细审查与公司以及下属项目部签订的劳动合同和公司规章制度，确保自己的行为不违反任何相关规定。
- 咨询专业意见：如果员工对自己的行为是否合法存在疑问，或者担心可能面临的法律后果，建议咨询专业的劳动法律师或税务律师，以获取准确的法律意见和指导。
- 依法纳税：无论领取几份工资，员工都应依法进行个人所得税的申报和缴纳，避免税务违法带来的风险。
可能后果：
- 如果员工的行为被认定为违法或违反公司规定，可能面临公司内部的纪律处分，甚至被解除劳动合同。
- 如果员工未依法纳税，可能面临税务机关的处罚，包括补缴税款、滞纳金、罚款等，严重情况下还可能涉及刑事责任。
总之，在公司和下属项目部同时领取两份工资是否违法，取决于多种因素，包括劳动关系的合法性、公司规定与劳动合同的内容以及税法的规定等。因此，在做出决定之前，员工应充分考虑这些因素，并咨询专业意见以确保自己的行为合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。