结论：药店在节假日未安排员工放假且扣工资的行为，是否违法需分情况讨论，具体如下：

1. 若节假日属于法定节假日：

   • 法律规定：根据《劳动法》第四十四条，法定节假日安排劳动者工作的，需支付不低于工资的300%的工资报酬，且不得以调休替代。若药店未支付3倍工资，反而扣减员工原工资，则属于违法行为。
   • 举例说明：如春节、国庆节等法定假日，员工被安排上班但未获3倍工资，药店还扣减其基本工资，员工可要求药店补发工资差额，并可向劳动监察部门投诉。

2. 若节假日属于休息日（如周末）：

   • 法律规定：休息日安排工作且不能调休的，需支付不低于工资的200%的工资报酬。若药店未安排调休也未支付2倍工资，反而扣减工资，则同样违法。
   • 举例说明：如员工周末被安排上班，药店未安排补休也未支付2倍工资，还扣减其工资，员工有权要求药店补发工资差额。

3. 若药店与员工有特殊约定或规章制度：

   • 前提条件：药店的规章制度或劳动合同中明确约定了节假日工作的工资支付标准，且该约定不违反法律强制性规定（如不低于最低工资标准、不免除法定支付义务等）。
   • 分析：若约定合法有效，药店按约定执行则不违法；但若约定违法（如约定节假日不支付任何工资），则该约定无效，药店仍需按法律规定支付工资。

法律建议：

• 员工角度：若遇到药店违法扣减工资的情况，可先与药店协商要求补发工资；协商无果的，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。
• 药店角度：应严格遵守《劳动法》及相关规定，合理安排员工节假日工作，并依法支付工资报酬，避免因违法扣减工资而引发劳动争议。

可能后果：

• 若药店被认定违法扣减工资，除需补发工资差额外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等；情节严重的，还可能影响药店的信誉和经营。

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