在工资纠纷中，起诉的对象取决于具体的法律关系和责任主体，可能是公司本身，也可能是其分支机构（分工公司），甚至在某些情况下两者均可作为被告。以下是对此问题的详细分析：
一、起诉公司的情况
直接雇佣关系：
- 如果劳动者直接与公司签订劳动合同，并由公司直接支付工资，那么当公司拖欠或未足额支付工资时，劳动者应当直接起诉公司。
- 在这种情况下，公司是工资支付的直接责任主体，劳动者有权要求公司支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
公司作为法人实体：
- 公司作为独立的法人实体，具有承担民事责任的能力。因此，当公司违反劳动合同或劳动法规定时，劳动者可以起诉公司要求其承担相应的法律责任。
二、起诉分支机构（分工公司）的情况
分支机构具有独立经营权：
- 如果分支机构（分工公司）具有独立的经营权，并且以自己的名义与劳动者签订劳动合同、支付工资，那么在某些情况下，劳动者也可以直接起诉分支机构。
- 这通常取决于分支机构是否具备独立的法人资格或是否经过授权可以独立承担民事责任。
分支机构作为实际用工单位：
- 在某些情况下，虽然劳动合同是与公司签订的，但实际用工和工资支付是由分支机构进行的。如果分支机构存在拖欠工资等违法行为，劳动者也可以考虑将分支机构作为共同被告或单独被告进行起诉。
- 然而，这需要根据具体案件情况和相关法律法规进行判断，因为并非所有分支机构都具备独立承担民事责任的能力。
三、起诉公司与分支机构（分工公司）的联合情况
共同责任：
- 在某些复杂情况下，公司和分支机构可能共同对劳动者的工资支付承担责任。例如，公司可能通过分支机构进行用工管理，但工资支付由公司直接进行或由公司和分支机构共同进行。
- 在这种情况下，劳动者可以将公司和分支机构作为共同被告进行起诉，要求它们共同承担支付拖欠工资的责任。
法律程序上的考虑：
- 在起诉时，劳动者需要仔细分析劳动合同、工资支付记录等证据材料，以确定责任主体。
- 如果劳动者不确定应该起诉谁，可以咨询专业律师进行法律分析和指导。
四、法律建议
收集证据：
- 在起诉前，劳动者应尽可能收集与工资支付相关的证据材料，如劳动合同、工资条、银行转账记录等。
- 这些证据将有助于证明劳动关系和工资支付情况，为起诉提供有力支持。
咨询专业律师：
- 由于工资纠纷涉及复杂的法律关系和责任主体判断，劳动者在起诉前应咨询专业律师进行法律分析和指导。
- 律师可以根据具体案件情况提供针对性的法律建议，帮助劳动者确定起诉对象并制定合适的诉讼策略。
总结来说，在工资纠纷中起诉谁取决于具体的法律关系和责任主体。劳动者应根据自己的实际情况和证据材料进行分析和判断，并在必要时咨询专业律师以获取更准确的法律建议。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。