结论前置：助教离职时扣工资是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果助教与用人单位（如学校、培训机构等）在劳动合同中明确约定了离职时工资的扣除条件或比例，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照合同约定执行是合法的。例如，合同中可能规定，若助教未提前通知离职或未完成交接工作，用人单位有权扣除一定比例的工资作为违约金或赔偿金。
   • 但需注意：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定的违约金条款通常仅限于服务期和竞业限制两种情形。若合同中约定的离职扣工资条款超出这一范围，可能被视为无效条款。

2. 法律法规角度：

   • 在没有合同约定或合同约定无效的情况下，用人单位不得随意扣除助教的工资。根据《劳动法》和《工资支付暂行规定》等法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。离职时，除非有法定情形（如劳动者给用人单位造成经济损失且需赔偿），否则用人单位不得扣除工资。
   • 法定情形示例：若助教在离职前因故意或重大过失给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求其赔偿，并从工资中扣除。但扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，即使存在合同约定或法定情形，用人单位在扣除工资时也需谨慎处理。他们应当确保扣除的金额合理、合法，并保留相关证据以证明扣除的合理性。否则，助教有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位支付被扣除的工资。

建议与后果：

• 对助教的建议：在离职前，助教应仔细阅读劳动合同中的相关条款，了解离职时工资的支付规定。若对合同条款有疑问或认为用人单位的行为违法，可以及时向劳动监察部门咨询或投诉。
• 对用人单位的建议：用人单位在制定劳动合同和规章制度时，应确保相关条款合法、合规，并明确告知劳动者。在离职处理时，应遵循法律法规的规定，避免随意扣除工资引发劳动争议。
• 可能的法律后果：若用人单位违法扣除助教的工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付被扣除的工资、加付赔偿金等。同时，助教也有权通过法律途径维护自己的合法权益。

总结：助教离职时扣工资是否合法，需根据合同约定、法律法规以及实际操作情况综合判断。若您对此有疑问或遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。