劳务合同中工时制度的选择需根据具体工作性质、行业特点及双方协商确定，综合工时制与弹性工时制均有可能适用，但需满足法定条件并履行相应程序。以下从两种工时制度的定义、适用条件及法律后果等角度进行详细分析：
一、综合工时制
定义：综合工时制是指用人单位因工作情况特殊或受季节和自然条件限制，需安排职工连续作业，无法实行标准工时制度，而采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的工时制度。
适用条件：
- 行业限制：通常适用于交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业，以及地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的岗位。
- 审批程序：用人单位需向劳动保障行政部门提出申请，经批准后方可实施。未经批准，擅自实行综合工时制的，将面临行政处罚。
法律后果：
- 工作时间计算：在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。
- 加班工资支付：超过部分应视为延长工作时间，并按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付劳动者工资；在法定节假日工作的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付劳动者工资。
二、弹性工时制
定义：弹性工时制是指劳动者每日工作时间可有一定弹性，但需确保完成规定的工作任务或固定的工作时间长度。它通常包括核心工作时间和弹性工作时间两部分。
适用条件：
- 岗位特性：适用于工作成果难以量化、工作过程难以监控的岗位，如研发、设计、销售等。
- 双方协商：弹性工时制的实施需用人单位与劳动者协商一致，并签订书面协议。协议中应明确弹性工作时间的具体安排、工作任务、考核标准等。
法律后果：
- 工作时间管理：用人单位应确保劳动者的平均每日工作时间和平均每周工作时间不超过法定标准工作时间。
- 加班工资支付：若因工作需要，劳动者在弹性工作时间外加班的，用人单位应按照法定标准支付加班工资。
三、综合建议
- 根据工作性质选择：若工作受季节和自然条件限制，或需连续作业，综合工时制可能更为合适；若工作成果难以量化，且工作过程难以监控，弹性工时制可能更为灵活。
- 履行审批或协商程序：无论选择哪种工时制度，均需履行相应的审批或协商程序，确保合法合规。
- 明确双方权利义务：在劳务合同中明确工时制度的具体安排、工作任务、考核标准、加班工资支付等条款，以避免后续纠纷。
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