可以申请劳动仲裁。以下是详细分析：

1. 编外人员与事业单位的劳动关系认定
   根据《劳动合同法》第二条，事业单位与劳动者建立劳动关系时，无论是否为编制内人员，只要形成事实劳动关系（如实际提供劳动、接受管理、领取报酬），均受劳动法保护。编外人员虽未纳入编制，但若与事业单位签订劳动合同或形成事实用工关系，其权益同样受法律保障。

2. 养老保险缴纳的强制性规定
   根据《社会保险法》第五十八条、第六十条，用人单位必须自用工之日起30日内为劳动者办理社保登记，并按时足额缴纳社会保险费（包括养老保险）。未依法缴纳社保属于违法行为，无论劳动者是否为编制内人员，用人单位均无权免除该义务。

3. 劳动仲裁的适用性
   若事业单位未按实际工资基数缴纳养老保险，编外人员可通过劳动仲裁主张以下权利：

   • 要求单位补缴养老保险差额（需提供工资流水、劳动合同等证据）；
     
   • 若因未缴社保导致损失（如无法享受养老金待遇），可要求单位赔偿；
     
   • 若单位拒不补缴，劳动者可向社保征收机构（如税务局）投诉，由行政部门强制征缴。

4. 实务操作建议

   • 证据收集：保留劳动合同、工资条、考勤记录等证明劳动关系的材料，以及社保缴费记录（显示缴费基数与实际工资不符的证据）；
     
   • 仲裁时效：注意《劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定的1年仲裁时效（从知道或应当知道权利被侵害之日起计算）；
     
   • 程序选择：可先与单位协商补缴，协商不成再申请仲裁；若单位存在恶意拖欠，可同步向社保部门举报。

总结：编外人员有权就养老保险缴纳问题申请劳动仲裁，但需注意证据充分性和时效限制。若需进一步分析具体案情或协助准备材料，可直接向我咨询。