多发工资是否构成刑事案件立案标准，需结合具体金额和情节判断，但民事纠纷无金额限制，任何多发情况均可通过法律途径解决。具体分析如下：

1. 刑事立案标准（可能涉及职务侵占罪或诈骗罪）
   若员工通过虚构事实、隐瞒真相（如伪造考勤记录）或利用职务便利（如财务人员故意多打款）非法占有多发工资，且金额达到当地“数额较大”标准（通常为6万元以上，各地可能不同），可能构成刑事犯罪。此时，公司可向公安机关报案，由警方立案侦查。
   关键点：需证明员工存在主观故意和非法占有目的，且金额达到刑事标准。

2. 民事纠纷处理（无金额限制）
   若员工无主观恶意（如系统错误、计算失误导致多发），则属于不当得利，公司可通过民事诉讼要求返还。此时，无论金额大小，法院均会受理。
   操作建议：公司应先与员工协商返还；若拒绝，可发送律师函催告；仍不返还的，向法院起诉（需提供工资发放记录、员工确认收款的证据等）。

3. 实务风险提示

   • 公司需保留完整工资发放记录（如银行流水、签字确认的工资条），以证明多发事实。
     
   • 若员工已离职，公司仍可追偿，但需注意诉讼时效（一般为3年，自知道或应当知道权利受损之日起算）。
     
   • 若员工将多发工资用于偿还个人债务或转移财产，公司可申请法院冻结其账户或财产。

总结：若怀疑员工恶意侵占且金额较大（如超过6万元），可报警追究刑事责任；若为无恶意的不当得利，无论金额多少均可直接起诉要求返还。具体操作需结合证据和情节判断，如有疑问可进一步向我咨询细节。