结论：侵占公款后解除协议是否合法，不能一概而论，需根据侵占公款的具体行为性质、解除协议的原因及程序等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 侵占公款行为的性质

   • 刑事违法性：侵占公款，若数额较大且拒不退还，可能构成职务侵占罪或贪污罪（视主体身份而定），属于刑事违法行为。一旦构成犯罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
   • 民事违法性：即使侵占公款行为未达到刑事犯罪的程度，也可能构成民事上的不当得利或侵权行为，侵占者需承担返还财产、赔偿损失等民事责任。

2. 解除协议的原因及程序

   • 合法解除：若解除协议是基于合法、正当的理由，如合同目的无法实现、对方严重违约等，且按照法定程序进行（如提前通知、协商一致等），则解除协议本身是合法的。但需注意，解除协议并不能免除侵占公款者因侵占行为而应承担的法律责任。
   • 非法解除：若解除协议是为了掩盖侵占公款的事实，或解除程序存在瑕疵（如未提前通知、未协商一致等），则解除协议可能被视为非法或无效。此时，不仅解除协议的行为可能受到法律制裁，侵占公款的行为也将面临更严重的法律后果。

3. 侵占公款与解除协议的关系

   • 因果关系：若侵占公款是导致协议解除的直接原因（如因侵占导致公司资金链断裂，无法履行合同义务），则解除协议可能被视为侵占行为的后果之一。但即便如此，解除协议本身并不能成为侵占公款的合法理由。
   • 独立性：侵占公款与解除协议在法律上是两个独立的行为。侵占公款需承担刑事责任或民事责任，而解除协议则需根据合同法和相关法律规定判断其合法性。两者不能相互抵消或免除责任。

法律建议：

• 对于侵占公款者，应立即停止侵占行为，并主动退还侵占的公款。若已构成犯罪，应积极配合司法机关的调查和处理，争取从轻或减轻处罚。
• 对于希望解除协议的一方，应确保解除协议的原因合法、正当，且按照法定程序进行。同时，应明确解除协议并不免除对方因侵占公款而应承担的法律责任。
• 若双方对侵占公款和解除协议的问题存在争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决争议，以维护自身合法权益。

可能法律后果：

• 侵占公款者可能面临刑事处罚或民事赔偿。
• 非法解除协议者可能面临合同违约责任或行政处罚（如适用）。
• 若侵占公款与解除协议的行为相互关联，且均构成违法或犯罪，则侵占者可能面临更严重的法律后果。