结论前置：打成轻伤后，即使双方已经签订了协议，被害人仍然有权选择起诉，但具体能否成功起诉并获得支持，需根据协议的有效性、是否存在可撤销情形以及是否涉及刑事犯罪等多方面因素综合判定。
一、民事赔偿部分
协议有效性：
- 如果双方自愿达成协议，且该协议内容合法、不违背公序良俗，那么该协议具有法律效力，对双方均有约束力。在此情况下，如果一方反悔并试图重新确定民事赔偿责任，法院通常不会支持，除非存在可撤销的法定情形。
可撤销情形：
- 若签订协议时存在重大误解、显失公平、欺诈、胁迫等可撤销情形，如受伤方因不了解伤情严重程度而签订了明显不合理的赔偿协议，或受到胁迫而被迫签字，那么受伤方有权在知道或应当知道撤销事由之日起一年内向法院起诉要求撤销协议，并重新确定赔偿责任。
违约责任：
- 如果一方不按照协议约定履行义务，如未按时支付赔偿款，另一方有权向法院提起诉讼，要求对方履行协议或承担违约责任。
二、刑事责任部分
公诉性质：
- 轻伤可能涉及故意伤害罪等刑事犯罪，这类犯罪具有公诉性质，由检察院代表国家提起公诉，不受被害人意志影响。即使双方达成了协议，被害人接受了赔偿并表示不再追究对方责任，司法机关仍可根据案件事实和证据决定是否对犯罪嫌疑人提起刑事诉讼。
刑事诉讼程序：
- 公安机关立案侦查后，认为犯罪事实清楚、证据确实充分的，会将案件移送检察院审查起诉。检察院经审查符合起诉条件的，会向法院提起公诉，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。协议仅能解决民事赔偿部分，不能替代刑事诉讼程序。
三、实际操作建议
审查协议：
- 在考虑起诉前，应仔细审查协议内容，确认是否存在可撤销情形或违法条款。如果协议存在问题，应及时咨询律师，了解撤销协议或重新确定赔偿责任的可行性。
收集证据：
- 如果决定起诉，应积极收集相关证据，如伤情鉴定报告、协议文本、支付凭证等，以支持自己的主张。
咨询律师：
- 由于法律程序复杂且涉及专业法律知识，建议在起诉前咨询专业律师，了解起诉的可行性、可能面临的法律后果及应对策略。
四、特殊情况下的处理
- 在某些特殊情况下，如犯罪嫌疑人真诚悔罪，并通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，双方可以达成和解。但这并不意味着刑事责任被完全免除，而是可能作为量刑时的从轻情节予以考虑。具体处理如下：
- 公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议；
- 人民检察院可以向人民法院提出从宽处罚的建议；
- 对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，人民检察院可以作出不起诉的决定；
- 人民法院在量刑时也会充分考虑和解情节，对犯罪嫌疑人予以从轻处罚。
综合总结：打成轻伤后，即使双方已经签订了协议，被害人仍然有权选择起诉。但具体能否成功起诉并获得支持，需根据协议的有效性、是否存在可撤销情形以及是否涉及刑事犯罪等多方面因素综合判定。在处理此类纠纷时，建议积极咨询律师，了解自己的法律权益和责任，以便在必要时采取适当的法律措施保护自己的合法权益。