针对您提出的“公司出纳不来上班且持有公司现金存于其个人卡里”的情况，这属于严重的职务违规行为，可能涉及职务侵占或挪用资金等法律风险，公司应立即采取措施保护自身权益。以下是具体分析和处理建议：

一、法律定性分析

1. 职务侵占风险
   根据《刑法》第271条，若出纳利用职务便利将公司财物非法占为己有（如拒不归还现金），数额较大的可能构成职务侵占罪。公司需证明现金属于公司财产且出纳存在非法占有目的。

2. 挪用资金风险
   若出纳将现金用于个人用途（如消费、投资等）且未在合理期限内归还，可能触犯《刑法》第272条挪用资金罪。即使未达刑事标准，也可能违反《公司法》中董事、监事、高管忠实义务的规定。

3. 劳动纪律问题
   出纳无故旷工违反《劳动合同法》第39条，公司可依据规章制度解除劳动合同，但需注意程序合法性（如提前通知工会、留存旷工证据等）。

二、公司应采取的紧急措施

1. 固定证据链

   • 立即封存出纳经手的财务账目、银行流水、现金日记账等原始凭证；
     
   • 收集出纳旷工的考勤记录、沟通记录（如微信、邮件）等证据；
     
   • 若现金存入出纳个人账户，需调取银行转账记录证明资金流向。

2. 发送书面催告
   通过EMS向出纳发送《限期返还款项通知书》，明确要求其：

   • 立即返还原属公司的现金；
     
   • 说明资金去向及未到岗原因；
     
   • 告知逾期不还的法律后果（包括刑事报案、民事诉讼等）。

3. 启动内部调查
   成立专项小组核查：

   • 现金缺失的具体金额及时间；
     
   • 出纳是否存在其他违规操作（如虚开发票、伪造凭证等）；
     
   • 财务流程是否存在漏洞（如印章管理、审批权限等）。

三、后续法律行动方案

1. 刑事报案
   若出纳拒不归还且金额较大（通常6万元以上），可向公安机关经侦部门报案，提交证据材料并配合调查。刑事立案后，公安机关有权冻结出纳账户、查封财产。

2. 民事诉讼
   同步提起民事诉讼，主张：

   • 返还被侵占的现金及利息；
     
   • 赔偿因违规行为导致的损失（如审计费用、资金占用损失等）；
     
   • 若出纳行为构成违约，可要求解除劳动合同并主张违约金（如有约定）。

3. 劳动仲裁
   若出纳旷工持续，公司可依据《劳动合同法》第39条解除劳动合同，并通过劳动仲裁确认解除合法性，避免支付经济补偿金。

四、风险防范建议

1. 完善财务制度

   • 实行“钱账分管”原则，出纳不得兼任会计；
     
   • 严格现金管理，超过一定金额必须通过银行转账；
     
   • 定期轮岗并强制休假，防范长期作案风险。

2. 加强法律培训
   定期组织财务人员学习《刑法》《公司法》《会计法》中涉及职务犯罪的条款，明确法律红线。

3. 购买雇主责任险
   投保“雇员忠诚保险”，转移因员工舞弊导致的经济损失风险。

提示：处理此类事件需兼顾效率与合规性，建议公司委托律师全程参与证据收集、法律文书起草及与司法机关沟通，以最大限度维护权益。如有进一步细节需要分析，可随时向我补充说明。