您好，关于商业用地是否可以按协议出让办理出让合同的问题，我可以为您详细解答。

首先，需要明确的是，商业用地因其经营性和盈利性的特点，其出让方式受到法律的严格规定。根据我国相关法律规定，商业用地的出让必须严格遵守招标、拍卖、挂牌或协议这四种方式。

关于协议出让：

协议出让是土地使用者与市、县人民政府土地行政主管部门通过协商的方式确定土地使用者和土地价格的一种出让方式。虽然这种方式相对灵活，但其使用受到严格限制。通常，协议出让只适用于特定情况，如划拨土地使用权转让、国有企业改革处置划拨土地使用权及特殊用途等用地。

商业用地的出让方式：

对于商业用地，由于其经营性和盈利性，法律更倾向于通过公开、公平、公正的方式出让，以确保土地资源的合理配置和市场公平竞争。因此，商业用地通常通过招标、拍卖或挂牌的方式出让。这些方式能够吸引多家单位参与竞争，有助于选择最优的土地使用者，并最大限度地实现土地的市场价值。

结论：

虽然协议出让是土地出让的一种方式，但商业用地通常不采用协议出让的方式办理出让合同。商业用地的出让更倾向于通过招标、拍卖或挂牌等公开、公平、公正的方式进行。这样的规定旨在确保土地资源的合理配置，维护市场公平竞争，以及实现土地的最大价值。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。