在劳动仲裁申请中，若公司注册地址与实际办公地点不一致，您在填写申请资料时应以公司注册地址为准，同时可补充说明实际办公地点信息。具体操作建议如下：

1. 被申请人信息填写
   在《劳动仲裁申请书》的”被申请人”一栏中，需填写公司工商注册登记的全称、统一社会信用代码、注册地址（可通过国家企业信用信息公示系统查询确认）。这是法律文书送达的法定依据，若填写错误可能导致仲裁程序受阻。

2. 事实与理由部分补充说明
   在陈述案件事实时，可明确注明：”被申请人实际经营地址位于XX市XX区XX路XX号（与注册地址不一致）”，并附上相关证据（如劳动合同签署地、工资发放记录、考勤记录、工作证等能证明实际办公地点的材料）。这有助于仲裁机构确定管辖权及后续文书送达。

3. 管辖权选择依据
   根据《劳动争议调解仲裁法》第21条，劳动仲裁由劳动合同履行地或用人单位所在地的仲裁委管辖。若您选择向实际办公地（劳动合同履行地）的仲裁委申请，需在申请书中重点说明：

   • 劳动合同实际履行地与注册地不一致的事实
     
   • 实际办公地连续工作满一定期限的证据（如社保缴纳记录、工作邮件往来等）
     
   • 引用《劳动人事争议仲裁办案规则》第8条：”双方当事人分别向劳动合同履行地和用人单位所在地的仲裁委员会申请仲裁的，由劳动合同履行地的仲裁委员会管辖”

4. 证据清单制作建议
   除常规证据外，建议补充：

   • 办公场所照片（显示公司标识）
     
   • 快递收件地址截图（若公司使用实际办公地接收文件）
     
   • 同事证人证言（证明实际工作地点）
     
   • 税务申报记录（部分地区可通过电子税务局查询纳税地址）

特别提醒：若公司注册地与实际办公地跨行政区划（如注册在A区，实际在B区工作），需提前确认两地仲裁委的管辖权划分。部分城市会出台专门规定（如北京规定”注册地与经营地不一致的，由经营地仲裁委管辖”），建议通过当地仲裁委官网或12348法律服务热线核实。

如需进一步帮助，可告知您所在城市及具体案情，我将结合地方性法规为您提供更精准的指导。