核心结论：员工合同到期时公司原计划不续签，但此时员工怀孕的，公司不能直接以合同到期为由终止劳动合同，而应当依法顺延至相应情形消失时终止。以下是具体分析：

1. 法律对“三期”女职工的特殊保护
   根据《劳动合同法》第四十二条、第四十五条规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的（简称“三期”），用人单位不得以“劳动合同期满”为由终止劳动合同，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止（即哺乳期结束）。因此，若员工在合同到期时已怀孕，公司原“不续签”的决定因违反法律强制性规定而无效，劳动合同需自动顺延。

2. 顺延期间的权利义务

   • 工资待遇：公司需按原劳动合同约定支付工资，不得因顺延而降低待遇；
     
   • 社保缴纳：公司需继续为员工缴纳社会保险至顺延期满；
     
   • 合同终止时间：顺延期从员工怀孕之日起计算，至哺乳期结束（通常为婴儿满1周岁），若员工存在难产、多胞胎等情形，哺乳期可相应延长。

3. 公司可能面临的法律风险
   若公司强行终止劳动合同，可能构成违法解除，需承担以下后果：

   • 继续履行合同：员工可要求公司恢复劳动关系；
     
   • 支付赔偿金：若员工不要求继续履行，公司需按经济补偿标准的2倍支付赔偿金（经济补偿按工作年限计算，每满1年支付1个月工资）；
     
   • 行政处罚：劳动行政部门可能对公司责令改正或处以罚款。

4. 实务建议

   • 核实怀孕事实：公司可要求员工提供医疗机构出具的怀孕证明，避免因信息不实引发纠纷；
     
   • 书面通知顺延：合同到期前，公司应向员工发送《劳动合同顺延通知书》，明确顺延期限及依据；
     
   • 关注顺延结束时间：在顺延期满前，公司可提前与员工协商是否续签劳动合同，避免再次面临合同到期问题。

总结：员工怀孕导致劳动合同顺延是法律的强制性规定，公司需严格遵守。若您对具体操作流程或风险防范有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细方案。