怀孕期间跟公司协商按最低工资发放，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若双方协商一致且符合法律规定：

   • 如果您与公司经过充分沟通，双方自愿达成一致，同意在怀孕期间按照最低工资标准发放，并且这一安排没有违反国家关于最低工资标准、女职工特殊保护等相关法律法规的强制性规定，那么这种安排在法律上是允许的。但这种情况较为特殊，因为通常最低工资标准远低于女职工正常工作时的工资水平，且孕期女职工需要更多的经济支持。

2. 若未经协商或协商不一致，公司单方面决定按最低工资发放：

   • 这是不合法的。根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》、《女职工劳动保护特别规定》以及《中华人民共和国妇女权益保障法》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得降低其工资、予以辞退或与其解除劳动（聘用）合同。这些法律条款旨在保护女职工在特殊生理时期的合法权益，确保她们不会因生育行为而遭受经济上的不合理损失。
   • 具体法律依据：
     • 《女职工劳动保护特别规定》第五条明确规定：“用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。”
     • 《中华人民共和国妇女权益保障法》第二十七条也强调：“任何单位不得因结婚、怀孕、产假、哺乳等情形，降低女职工的工资、予以辞退或与其解除劳动（聘用）合同。”

3. 特殊情况下的合法降薪：

   • 尽管法律对孕期女职工的工资待遇有明确的保护，但也存在特殊情况。如果用人单位能够证明女职工在怀孕期间不能胜任原工作岗位，并且经过培训或者调整工作岗位后仍不能胜任工作，那么根据公司合法有效的规章制度进行合理的岗位和工资调整可能是被允许的。但这种情况下，用人单位需要承担严格的举证责任，证明降薪行为的合法性和合理性，同时确保工资降低的幅度合理且符合法律法规的要求。不过，这种特殊情况并不适用于您所描述的“协商按最低工资发放”的情形。

建议与应对措施：

• 与公司协商：如果您对公司提出的按最低工资发放的安排有异议，首先可以尝试与公司进行协商，表达您的诉求和担忧，争取达成一个更合理的工资安排。
• 保留证据：无论协商结果如何，建议您都保留好所有与工资发放有关的证据，如工资单、劳动合同、沟通记录等，以备不时之需。
• 寻求法律援助：如果协商无果，或者公司存在违法行为，您可以向当地劳动保障部门投诉，寻求法律援助和维权帮助。在必要时，您也可以通过法律途径来维护自己的权益，包括提起劳动仲裁或诉讼。

总之，怀孕期间跟公司协商按最低工资发放是否合法，取决于双方是否协商一致以及是否符合相关法律法规的规定。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。