公司安排工作日扣年假是否合法，需结合具体情况判断。以下是从不同角度进行的分析：
合法情形
因生产、工作需要并经员工同意：
- 根据《职工带薪年休假条例》第五条，若因生产、工作需要，公司不安排或少安排员工的年休假，应经员工本人同意，并按照员工日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬（包含正常工作期间的工资收入）。这种情况下，公司安排工作日扣年假并支付相应报酬是合法的。
员工病假累积达到一定期限：
- 根据《职工带薪年休假条例》第四条，累计工作年限不足10年的员工，病假累积达2个月以上；累计工作年限超过10年但不足20年的员工，病假累积达3个月以上；累计工作年限超过20年的员工，病假累积达4个月以上。在这些情况下，企业可无需安排其年假，因此安排工作日扣年假（实际为不安排年假）是合法的。
员工请假超出可支配年假范围：
- 如果员工在已休完法定年假后，又申请额外假期并被认定为占用年假额度，且公司有明确的年假管理规定并已向员工公示说明，此时扣除相应年假天数通常是合理的。
违法情形
无正当理由随意扣除：
- 年假是员工依法享有的福利，公司若无合理原因（如员工严重违反规章制度）而随意扣减年假天数，则侵害了员工的合法权益，构成违法。
未按规定安排补休或支付补偿：
- 当员工因工作需要无法在正常年度内休完年假时，公司应要么安排补休，要么按照员工日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬。若公司既不安排补休也不支付相应报酬而直接扣减年假，则属于违法行为。
员工权益保护建议
- 沟通协商：首先与公司进行沟通，了解扣年假的具体原因，并要求公司说明依据并纠正错误做法。
- 保存证据：妥善保存相关证据，如公司通知、工作记录、工资单等，以备后续维权使用。
- 投诉或仲裁：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
举例说明：
假设某员工因公司业务繁忙，无法在正常年度内休完年假，且公司未经员工同意直接扣减了年假天数，也未支付未休年休假工资报酬。这种情况下，公司的行为就构成了违法，员工有权要求公司支付相应的报酬或采取其他补救措施。
又如，某员工因个人原因申请了额外假期，且该假期被公司认定为占用年假额度。如果公司有明确的年假管理规定并已向员工公示说明，且员工在申请假期时已知悉并同意该规定，那么公司扣除相应年假天数的行为就是合法的。
综上所述，公司安排工作日扣年假的合法性需根据具体情况来判断。员工应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。