结论：事业单位员工休年假时，年假天数中不包含周六、周日，即周六、周日不计入年假天数内，不会从年假总天数中扣除。

详细解释：

1. 年假天数的计算依据：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第三条，职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。这里的“天”指的是工作日，即排除了周六、周日等休息日。

2. 年假与休息日的区别：

   • 年假是职工在工作满一定年限后，依法享有的带薪休假权利，其目的是为了保障职工的休息和身心健康。
   • 周六、周日是法定的休息日，属于职工的正常休息时间，不计入年假天数。

3. 年假期间的休息日安排：

   • 如果年假期间恰好包含周六、周日，那么这些休息日不会从年假总天数中扣除。例如，如果某职工享有5天年假，且这5天中包含了1个周六和1个周日，那么该职工实际上仍然享有5天的年假，不会因为周六、周日的存在而减少。

4. 特殊情况下的年假计算：

   • 如果职工在年假期间因工作需要加班，那么加班的天数应当按照国家规定支付加班费，并且这些加班的天数不会计入年假天数内。
   • 如果职工在年假期间因个人原因（如病假、事假等）需要请假，那么请假天数可能会从年假天数中扣除，具体取决于单位的规定和劳动合同的约定。但周六、周日作为休息日，仍然不会计入扣除的天数内。

建议：

• 事业单位员工在休年假前，应当了解自己享有的年假天数以及单位的具体规定，以便合理安排休假时间。
• 如果在年假期间遇到特殊情况需要请假或加班，应当及时与单位沟通并了解相关政策和规定，以保障自己的合法权益。

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