生病住院期间给予员工警告处分是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
若员工因病住院属于法定医疗期，且住院原因与工作无关：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工在法定医疗期内享有病假工资、医疗待遇等权益，用人单位不得随意解除劳动合同或给予纪律处分。
- 若用人单位在员工法定医疗期内，仅因员工住院就给予警告处分，且该处分与员工住院行为无直接关联（如员工未违反公司规章制度），则该处分行为可能构成违法。因为此时员工处于需要医疗和休息的特殊状态，用人单位应给予必要的关怀和照顾，而非施加纪律处分。
若员工因病住院期间存在违反公司规章制度的行为：
- 如果员工在住院期间，虽然身体不适，但仍然通过其他方式（如远程办公、电话沟通等）违反了公司的规章制度（如泄露公司机密、未按时完成工作任务且无正当理由等），用人单位在查明事实后，有权根据规章制度给予相应的纪律处分，包括警告处分。
- 但需要注意的是，用人单位在给予处分时，应确保处分决定的合法性和合理性，充分考虑员工的实际状况和违规行为的性质、情节等因素。例如，如果员工因病情严重无法按时完成工作任务，且已及时向用人单位说明情况并寻求谅解，用人单位则不宜直接给予警告处分。
若员工住院属于工伤范畴：
- 如果员工因工作原因受伤住院，根据《工伤保险条例》等相关法律法规，员工在工伤治疗期间享有停工留薪期待遇，用人单位不得解除劳动合同或给予纪律处分。
- 在此情况下，用人单位给予员工警告处分显然是违法的，因为员工是在履行工作职责过程中受伤，应得到用人单位的保护和照顾。
法律建议：
- 对于员工而言，如果认为用人单位在住院期间给予的警告处分不合法，可以首先与用人单位进行沟通协商，要求撤销不合理的处分决定。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于用人单位而言，在给予员工纪律处分时，应严格遵守相关法律法规和公司规章制度，确保处分决定的合法性和合理性。同时，也应关注员工的实际状况和需求，给予必要的关怀和照顾。
可能后果：
- 如果用人单位在员工住院期间违法给予警告处分，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，要求撤销处分决定、恢复员工名誉、赔偿经济损失等。
- 对于员工而言，如果成功维护了自己的合法权益，不仅可以撤销不合理的处分决定，还可能获得相应的经济赔偿和精神抚慰。
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