在计算支付赔偿金时，若部分工资以现金形式发放，赔偿金的计算基数原则上应包含该部分现金工资，但需结合具体证据和法律规定来确定。以下是详细分析：

1. 赔偿金计算基数的一般原则
   根据《劳动合同法》及相关司法解释，赔偿金（如经济补偿金、赔偿金等）的计算基数通常为劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。这里的“工资”应理解为劳动者实际获得的全部劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入，无论以银行转账还是现金形式发放。

2. 现金工资的举证责任
   若部分工资以现金形式发放，劳动者需承担举证责任，证明该部分收入的存在及具体金额。常见证据包括：

   • 工资条、工资签收单等书面记录；
     
   • 银行流水（显示部分工资转账，其余现金补足）；
     
   • 同事证言（需注意证人出庭作证的可能性）；
     
   • 录音、聊天记录等间接证据（需符合证据合法性要求）。
     若劳动者无法提供充分证据，仲裁或法院可能仅以银行转账记录作为计算基数，导致赔偿金减少。

3. 用人单位的义务与风险
   用人单位有义务如实申报劳动者的工资收入。若用人单位主张现金部分不属于工资（如福利、报销等），需承担举证责任，证明该部分款项的性质。若用人单位无法证明，则可能被认定为工资，纳入赔偿金计算基数。
   风险提示：用人单位若通过现金发放工资逃避社保、个税等义务，可能面临行政处罚（如补缴社保、罚款），甚至刑事责任（如逃税罪）。

4. 实务建议

   • 对劳动者：
     
     • 保留所有工资发放记录（包括现金签收单）；
       
     • 要求用人单位出具完整工资条，明确工资构成；
       
     • 若发生纠纷，及时收集证据并申请劳动仲裁。
       
   • 对用人单位：
     
     • 规范工资发放形式，尽量通过银行转账并备注“工资”；
       
     • 完善工资台账，保留劳动者签收记录；
       
     • 避免将工资与福利、报销等混淆发放。

总结：现金工资应纳入赔偿金计算基数，但需以劳动者能举证为前提。若您涉及具体案件，建议提供工资发放记录、劳动合同等材料，以便进一步分析计算方式。