结论：根据您描述的情况，在厂里工作期间向中介借钱1300元后中介跑路，且工厂里只有您两天的工资，这一行为一般不构成诈骗罪，但可能涉及民事纠纷。以下从刑事和民事两个角度为您详细分析：

一、刑事角度：是否构成诈骗罪

1. 诈骗罪的构成要件：

   • 诈骗罪要求行为人以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物。
   • 关键在于行为人是否具有非法占有的故意，以及是否实施了欺骗行为。

2. 您的情况分析：

   • 您向中介借钱，并出具了借条或存在借款合意，这表明您最初并无非法占有的故意。
   • 中介跑路的行为，虽然导致您无法偿还借款，但这并不直接等同于您具有非法占有的故意。除非您在借款时就有预谋不还，或者借款后立即消失且无还款意愿，否则难以认定构成诈骗。
   • 借款金额1300元，通常也不达到诈骗罪的立案标准（具体标准因地区而异，但一般远高于此数额）。

3. 结论：

   • 基于上述分析，您的情况一般不构成诈骗罪。

二、民事角度：借款纠纷的处理

1. 借款关系的认定：

   • 您与中介之间存在借款关系，这是基于双方合意形成的民事法律关系。
   • 无论中介是否跑路，您都有义务偿还借款（如果借款事实成立且您确实收到了款项）。

2. 工厂工资与借款的关系：

   • 工厂里您两天的工资，是您应得的劳动报酬，与借款纠纷是两个独立的法律关系。
   • 工厂没有义务为中介的跑路行为负责，也没有义务直接从您的工资中扣除借款。

3. 建议处理方式：

   • 尝试联系中介：如果可能，尝试通过其他方式联系中介，要求其履行还款义务或协商解决方案。
   • 收集证据：保留借款时的相关证据，如借条、转账记录、聊天记录等，以备不时之需。
   • 法律途径：如果中介拒绝还款且无法联系，您可以考虑通过法律途径解决，如向法院提起民事诉讼要求中介还款。但需注意，诉讼成本（包括时间、金钱等）可能较高，需权衡利弊。

4. 关于工厂工资：

   • 您有权要求工厂支付您应得的工资。如果工厂拒绝支付，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

最后，虽然您的情况一般不构成诈骗罪，但借款纠纷仍需妥善处理。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细的法律建议和解决方案。