结论：公司员工外派非洲期间感染疟疾，回国后发病治疗，是否属于工伤，需根据具体情况判断，但一般情况下，若能证明感染疟疾与工作有直接关系，且符合工伤认定条件，则应认定为工伤。

分析说明：

1. 工伤认定的一般条件：

   • 根据《工伤保险条例》第十四条，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或者因履行工作职责受到暴力等意外伤害的，应当认定为工伤。此外，职工患职业病的，也应当认定为工伤。
   • 在此案例中，员工外派非洲期间感染疟疾，若能证明感染疟疾是因工作原因（如外派工作性质、工作环境等）导致的，且疟疾属于职业病范畴（或虽不属于传统职业病，但能证明与工作有直接关系），则符合工伤认定的一般条件。

2. 疟疾是否属于职业病：

   • 疟疾本身并不直接列入我国《职业病分类和目录》中，但关键在于是否能证明感染疟疾与工作有直接关系。例如，如果员工被派往疟疾高发区工作，且因工作需要长时间暴露在该环境中，导致感染疟疾，那么可以认为感染疟疾与工作有直接关系。
   • 在实际操作中，这可能需要通过医学证明、工作记录、外派合同等证据来支持。

3. 回国后发病治疗的工伤认定：

   • 即使员工回国后发病治疗，只要感染疟疾的事实发生在工作期间，且与工作有直接关系，就不影响工伤的认定。关键在于证明感染疟疾与工作之间的因果关系。
   • 员工应及时向公司报告病情，并保存好相关医疗记录、工作记录等证据，以便后续申请工伤认定。

4. 特殊情况下的工伤认定：

   • 如果员工在非洲期间已经出现疟疾症状，但因工作原因未能及时就医，回国后病情加重或复发，这种情况下也应考虑认定为工伤。
   • 另外，如果公司未按照相关规定为员工提供必要的防护措施或健康保障，导致员工感染疟疾，公司也可能需要承担相应的法律责任。

法律建议：

• 及时申请工伤认定：员工应在知道或应当知道自己感染疟疾之日起一定期限内（具体根据当地规定），向公司或当地社会保险行政部门提出工伤认定申请。
• 准备相关证据：员工应准备好医疗记录、工作记录、外派合同等证据，以证明感染疟疾与工作之间的因果关系。
• 咨询专业律师：如果员工在申请工伤认定过程中遇到困难或争议，建议咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果员工被认定为工伤，将享受工伤保险待遇，包括医疗费用报销、停工留薪期工资、伤残补助等。
• 如果公司未依法为员工缴纳工伤保险费，员工发生工伤的，由公司按照工伤保险待遇项目和标准支付费用。
• 如果员工未能被认定为工伤，但确实因工作原因感染疟疾，员工仍可以通过与公司协商、提起民事诉讼等方式寻求赔偿。

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