不上班扣工资是否合法，需根据具体情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、标准工时制下的情况
劳动者拒绝加班的权利：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，且每日一般不得超过一小时，特殊情况不超过三小时，每月累计不超过三十六小时。这表明，劳动者有权利拒绝不合理的加班安排。
- 若劳动合同中未明确规定加班为强制，员工有权选择是否加班。若选择不加班且未违反公司规定或劳动合同条款，用人单位无权扣工资。
扣工资的违法性：
- 工资是劳动者按劳动合同付出正常劳动后应得的报酬。用人单位以不加班为由扣工资，实际上是在克扣劳动者的劳动报酬，违反了《劳动法》第五十条，即“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资”。
- 即使劳动合同中有关于加班的约定，该约定也必须符合法律规定，不能损害劳动者的合法权益。例如，“员工必须无条件接受所有加班要求，否则扣工资”的霸王条款是无效的，因为它侵犯了劳动者的休息权和获得合理劳动报酬的权利。
二、特殊工时制下的情况
- 综合计算工时或不定时工作制：
- 在这两种工时制度下，工作时间可能相对灵活，可能根据工作完成情况或特定周期来计算工作时间。
- 在此类制度下，是否因不加班而扣工资，需结合具体的工作合同和公司规定来判断。但即使在这类制度下，扣工资也应有明确的制度依据，且不能违反法律法规关于最低工资、加班费支付等强制性规定。
三、特殊情况下的加班与扣工资
- 特定情形下的加班：
- 根据《劳动法》第四十二条，存在特定情形时（如自然灾害、事故威胁生命健康、生产设备故障影响生产等），用人单位安排加班可不受第四十一条的限制。在这些特殊情况下，劳动者可能无法拒绝加班。
- 但即便如此，用人单位也不能以不加班为由扣工资，因为工资是劳动者提供正常劳动后的报酬，与是否加班无直接关联。
四、劳动者的维权途径
协商与投诉：
- 如果用人单位存在不加班就扣工资的情况，劳动者首先可以尝试与用人单位协商，要求足额支付工资。
- 若协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，由其进行调查并责令用人单位改正违法行为。
劳动仲裁与诉讼：
- 如仍无法解决问题，劳动者可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付被克扣的工资及相应的赔偿金。
- 对仲裁结果不满意的，劳动者还可向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
总结与建议：
- 在标准工时制下，劳动者有权拒绝加班，且用人单位不得以不加班为由扣工资。
- 在特殊工时制下，需结合具体的工作合同和公司规定来判断，但扣工资仍需有明确的制度依据且不能违反法律法规。
- 无论何种情况，劳动者都应了解自己的权益，并在遇到问题时通过合法途径进行维权。
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