针对您提出的“货车司机在卸货时受伤，应该由雇主赔偿还是物流公司赔偿，以及工伤认定流程是怎样的”这一问题，我将从责任划分和工伤认定流程两个方面为您详细解答。

一、责任划分

1. 雇主或物流公司责任：

   • 如果司机与物流公司之间存在劳动关系，那么根据《工伤保险条例》，司机在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。此时，物流公司应负责为司机申请工伤认定，并承担相应的医疗费用和工伤赔偿。
   • 如果司机与雇主（如个人雇主或小型运输公司）之间形成的是雇佣关系，且司机是在从事雇佣活动中受伤的，那么雇主也应承担赔偿责任，包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金等。

2. 第三方责任：

   • 如果司机的受伤是由于货物所有人或管理人的过错造成的，如货物堆放不稳导致倒塌砸伤司机，那么货物所有人或管理人应承担相应的赔偿责任。
   • 如果存在其他第三方（如装卸工、其他车辆驾驶员等）的过错导致司机受伤，那么该第三方也应承担相应的赔偿责任。

3. 劳动者自身过失：

   • 如果司机在卸货过程中存在故意或重大过失，如违反操作规程、未佩戴安全防护用品等，导致自己受伤，那么可能需要自行承担部分或全部责任。但即使在这种情况下，如果用人单位或雇主未尽到安全管理职责，如未提供必要的安全培训、未配备合格的安全防护设备等，仍可能需要承担一定的赔偿责任。

二、工伤认定流程

1. 申请：

   • 所在单位（物流公司或雇主）应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 如果用人单位未按规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

2. 提交材料：

   • 提出工伤认定申请时，应当提交工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料（如劳动合同、工资支付记录等）、医疗机构出具的受伤后诊断证明书或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。

3. 调查核实：

   • 社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对事故伤害进行调查核实。用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。

4. 作出决定：

   • 社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。

综上所述，货车司机在卸货时受伤的责任归属需根据具体情况判断，可能涉及雇主责任、第三方责任及劳动者自身过失等情形。而工伤认定流程则包括申请、提交材料、调查核实和作出决定等步骤。希望这些解答能够帮助您更好地理解和处理这一问题。