加班调休扣绩效工资是否合理，需分情况讨论：
从劳动合同和公司规章制度的角度分析：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了加班调休不扣绩效工资，那么公司扣除绩效工资的行为就是不合法的。员工有权依据合同或规章制度要求公司补发被扣除的绩效工资。
- 反之，如果劳动合同或公司规章制度中允许在加班调休时扣除一定比例的绩效工资，且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司的行为可能是合法的。但这种情况较为少见，因为通常绩效工资是员工工作表现的奖励，与加班调休无直接关联。
从法律法规的角度分析：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，员工有权获得劳动报酬，包括基本工资和绩效工资等。加班调休是员工在超出正常工作时间后，由公司安排的休息时间，以补偿员工因加班而付出的额外劳动。
- 法律法规并未明确规定加班调休时是否可以扣除绩效工资。但是，如果扣除绩效工资导致员工的实际收入低于当地最低工资标准，或者违反了劳动合同中的约定，那么公司的行为就是违法的。
从公平合理的角度分析：
- 加班调休是员工应得的权益，公司不应通过扣除绩效工资等方式来变相剥夺这一权益。绩效工资是员工工作表现的直接反映，与加班调休无直接联系。因此，从公平合理的角度来看，加班调休时扣除绩效工资是不合理的。
建议：
- 如果员工遇到加班调休被扣绩效工资的情况，首先应查看劳动合同和公司规章制度中是否有相关规定。
- 如果合同或制度中无相关规定，或规定违反法律法规，员工可以与公司协商要求补发绩效工资。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司违法扣除绩效工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 员工也可能因此对公司产生不满，影响工作积极性和团队氛围。
总之，加班调休扣绩效工资是否合理，需根据具体情况来判断。员工应了解自己的权益，并在必要时采取法律手段来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。