结论：社平工资扣除百分之百但实际按百分之60缴纳社保，这种做法通常是违法的，具体分析如下：
社保缴纳基数的法律规定：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》及相关规定，社保缴纳基数通常是根据职工上一年度月平均工资来确定的，且这个基数有一个上下限的范围，即不得低于当地社平工资的60%，也不得高于当地社平工资的300%。这是为了保障职工的基本社保权益，防止社保缴纳过低或过高。
社平工资扣除百分之百但按百分之60缴纳的违法性：
- 如果公司声称按照社平工资的百分之百来计算社保缴纳基数，但实际上却按照社平工资的百分之60来缴纳，这种做法显然是违法的。因为这实际上降低了职工的社保缴纳基数，从而可能影响到职工未来的社保待遇，如养老金、医疗保险等。
- 此外，这种做法也违反了社保缴纳的公平原则，因为其他职工可能是按照实际工资或更高的比例来缴纳社保的，而这部分职工却享受了较低的社保待遇。
可能的法律后果：
- 对于公司来说，如果被发现存在这种违法行为，可能会面临社保部门的处罚，包括补缴社保费用、缴纳滞纳金以及可能的罚款等。
- 对于职工来说，如果发现自己的社保缴纳基数被降低，可以向社保部门投诉或举报，要求公司补缴社保费用，并维护自己的合法权益。
建议与行动：
- 如果你发现自己的社保缴纳基数被公司降低，首先应该与公司进行沟通，了解原因并要求公司按照法律规定进行补缴。
- 如果公司拒绝补缴或无法达成一致，你可以向当地的社保部门投诉或举报，并提供相关证据来支持你的主张。
- 在整个过程中，保留好所有相关的证据，如工资条、社保缴纳记录等，以便在需要时提供证明。
进一步思考：社保缴纳是职工和公司共同的责任和义务，也是保障职工未来生活的重要手段。因此，我们应该密切关注自己的社保缴纳情况，确保自己的权益不受侵害。如果你有任何关于社保缴纳的法律问题或疑虑，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。