借调人员的工资发放主体需依据原单位与借调单位之间的具体约定来确定，且这一约定应以书面协议的形式明确。以下是对此问题的详细分析：

一、工资发放的一般原则

在大多数情况下，借调人员的工资由原单位发放。这是因为借调仅改变了员工的工作地点和任务，其人事关系和劳动关系依然保留在原单位。原单位应按照正常的工资发放流程，为借调人员支付工资、奖金、福利等各项薪酬待遇，并负责缴纳社保等费用。例如，某政府部门员工被借调到另一政府部门工作，其工资仍由原单位发放。

二、协商约定的特殊情况

1. 由借调单位发放：

   • 在某些情况下，原单位与借调单位会协商约定，借调期间借调人员的工资由借调单位承担。这通常是因为借调人员参与借调单位的特定项目或工作，且该工作对借调单位具有重要意义，或者借调单位有相关的经费安排来支持借调人员的薪酬。例如，某企业员工被借调到另一企业参与一个重要项目，双方约定借调期间工资由借调企业发放。

2. 部分补贴由借调单位发放：

   • 还存在一种情况，即原单位发放基本工资，而借调单位根据借调人员的工作情况发放额外补贴。这种补贴通常是对借调人员在借调期间额外工作付出的一种补偿，旨在激励借调人员更好地完成工作任务。例如，借调单位考虑到借调人员通勤距离较远，每月给予一定的交通补贴。

3. 共同承担：

   • 在某些特殊情况下，原单位和借调单位可能会约定共同承担工资。例如，原单位发放基本工资以保障基本生活，而借调单位发放绩效工资或补贴以体现工作业绩。这种安排能够充分发挥双方的优势和积极性，促进借调人员的稳定和工作效率的提升。

三、保障借调员工的合法权益

无论工资由哪方发放，都应确保借调员工的合法权益得到充分保障。这包括但不限于工资待遇、工作时间、休息休假以及社会保险等各方面权益。如果因为借调关系导致员工的合法权益受到损害，员工有权依法向相关部门投诉或寻求法律援助。例如，借调单位未按照约定支付工资或加班费，借调人员可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

四、实际操作建议

1. 明确约定：

   • 在借调前，原单位与借调单位应签订书面借调协议，明确约定工资发放主体、支付方式及标准等事项。这有助于避免潜在的纠纷和风险。

2. 保留证据：

   • 借调人员应保留好与工资发放相关的证据，如工资条、银行转账记录等。这些证据在发生纠纷时可以作为维权的重要依据。

3. 及时沟通：

   • 在借调期间，借调人员应与原单位和借调单位保持及时沟通，确保工资发放等事项得到妥善处理。如果遇到问题或困难，应及时向相关部门反映并寻求帮助。

总结来说，借调人员的工资发放主体需根据原单位与借调单位之间的具体约定来确定。在一般情况下，工资由原单位发放；但在特殊情况下，也可能由借调单位全部或部分承担。无论如何，都应遵循法律法规，确保借调员工的合法权益得到妥善保护。如果你有具体的借调情况或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议。