结论：国企改制中员工对补偿待遇不公平不服的，仲裁机构一般可以受理，但需满足一定条件。
一、仲裁机构受理的基本条件
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议仲裁委员会负责管辖本区域内发生的劳动争议。员工与用人单位之间因改制补偿待遇问题产生的争议，属于劳动争议的范畴，因此仲裁机构在一般情况下是可以受理的。但需注意，员工需确保自己的仲裁请求在法律规定的时效期间内提出，通常为自知道或应当知道权利被侵害之日起一年内。
二、国企改制补偿待遇争议的特殊性
国企改制往往涉及复杂的法律关系和政策调整，员工对补偿待遇的不公平感可能源于多个方面，如改制方案的不透明、评估标准的不合理、补偿计算方式的歧义等。这些争议在仲裁过程中，除了需要依据一般的劳动法律法规外，还可能涉及国企改制的特定政策、文件以及企业内部规章制度等。
三、仲裁机构受理后的处理流程
受理与立案：员工向仲裁机构提交仲裁申请书及相关证据材料，仲裁机构在审查后认为符合受理条件的，将予以立案。
开庭审理：仲裁机构将组织双方当事人进行开庭审理，听取双方的陈述和辩论，审查证据材料，并可能进行调解。
裁决：在审理结束后，仲裁机构将根据查明的事实和适用的法律，作出裁决。裁决结果对双方当事人具有法律约束力。
四、员工在仲裁过程中的注意事项
准备充分证据：员工应尽可能收集并整理与补偿待遇争议相关的证据材料，如改制方案、评估报告、补偿计算表、工资单等，以支持自己的仲裁请求。
明确仲裁请求：员工在提交仲裁申请书时，应明确自己的仲裁请求，包括要求用人单位支付的具体补偿金额、支付方式、支付期限等。
遵守仲裁程序：员工应遵守仲裁机构的程序规定，按时参加开庭审理，配合仲裁机构的调查和调解工作。
五、其他解决途径
如果员工对仲裁结果不满意，还可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。此外，员工也可以考虑通过协商、调解等其他方式解决争议，以节省时间和成本。
建议：国企改制中的员工补偿待遇争议是一个复杂而敏感的问题，涉及多方面的法律关系和政策调整。如果你或你身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。