加班工时抵扣正常工时是否合法，需分情况讨论：
若劳动合同或规章制度有明确约定，且符合法律规定：
- 在某些情况下，如果劳动合同或公司的规章制度中明确规定了加班工时可以抵扣正常工时，并且这种规定不违反法律法规的强制性规定，那么这种抵扣可能是合法的。但这种情况较为特殊，且需要满足严格的条件，比如必须经过劳动者同意，且不能损害劳动者的合法权益。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动合同和规章制度应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则。如果加班工时抵扣正常工时的规定是在这个框架内制定的，且没有违反其他法律法规的强制性规定，那么它可能是有效的。但实际操作中，这种规定往往因为可能损害劳动者权益而受到严格限制。
若劳动合同或规章制度无明确约定，或约定违法：
- 在没有明确约定或约定违法的情况下，加班工时抵扣正常工时通常是不合法的。因为加班工时是劳动者在正常工作时间之外为用人单位提供的劳动，应当按照法律规定获得相应的加班工资或补休。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这表明，加班工时通常应当通过支付加班工资或安排补休来补偿，而不是直接抵扣正常工时。
实际操作中的注意事项：
- 即使劳动合同或规章制度中有关于加班工时抵扣正常工时的规定，用人单位也应当谨慎操作，确保不损害劳动者的合法权益。例如，不能通过强制或欺骗的方式让劳动者同意这种抵扣，也不能在抵扣后降低劳动者的工资水平或福利待遇。
- 劳动者在面对加班工时抵扣正常工时的情况时，应当仔细审查劳动合同和规章制度的相关规定，了解自己的权益和义务。如果认为这种抵扣不合法或损害了自己的权益，可以向用人单位提出异议或寻求法律援助。
建议：
- 对于用人单位而言，应当遵守法律法规的规定，合理制定劳动合同和规章制度，避免通过不合法的方式抵扣加班工时。如果确实需要安排加班，应当按照法律规定支付加班工资或安排补休。
- 对于劳动者而言，应当了解自己的权益和义务，仔细审查劳动合同和规章制度的相关规定。如果遇到加班工时抵扣正常工时的情况，且认为这种抵扣不合法或损害了自己的权益，可以及时向用人单位提出异议或寻求法律援助。
总结：加班工时抵扣正常工时是否合法，取决于劳动合同或规章制度是否有明确约定且符合法律规定。在没有明确约定或约定违法的情况下，这种抵扣通常是不合法的。因此，用人单位和劳动者都应当谨慎对待加班工时抵扣正常工时的问题，确保遵守法律法规的规定并维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。