公司用加班工时来抵基本工时，这一做法是否合法，需分情况讨论：
若公司制度或劳动合同中有明确约定，且符合法律法规：
- 根据《劳动法》及相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以实行不定时工作制或综合计算工时工作制。若公司制度或劳动合同中明确规定了加班工时可以抵扣基本工时，并且这种安排没有违反法律法规的强制性规定（如每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时等），同时保证了劳动者的休息权和报酬权，那么这种做法在一定程度上是可以被接受的。但需注意，即使如此，公司也应确保劳动者的总工作时间不超过法定标准，且加班应依法支付加班费或安排补休。
若公司制度或劳动合同中无明确约定，或违反法律法规：
- 如果公司制度或劳动合同中没有明确规定加班工时可以抵扣基本工时，或者这种安排违反了法律法规的强制性规定（如未经劳动行政部门批准实行特殊工时制度、未保证劳动者休息权等），那么公司用加班工时来抵基本工时的做法就是不合法的。在这种情况下，劳动者有权拒绝公司的安排，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《劳动法》第三十六条、第三十八条、第四十一条等规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。同时，用人单位应当保证劳动者每周至少休息1日。
- 建议：对于劳动者而言，如果公司提出用加班工时来抵基本工时的安排，应首先查看公司制度或劳动合同中是否有相关约定，并评估这种安排是否合法合规。如果认为公司的安排不合法或不合理，可以与公司进行协商沟通，或者向劳动监察部门投诉。对于公司而言，应确保所有工时安排都符合法律法规的规定，并充分尊重劳动者的权益和意愿。
可能法律后果：
- 如果公司用加班工时来抵基本工时的做法不合法，劳动者有权要求公司支付加班费或安排补休。如果公司拒绝支付或安排补休，劳动者可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁申请。在极端情况下，如果公司的行为严重违反了法律法规的规定，还可能面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。
总之，公司用加班工时来抵基本工时的做法是否合法，需根据具体情况进行判断。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。