没有书面合同的情况下，工程款和农民工工资的认定可通过以下途径实现，但需结合具体证据和法律关系综合判断：

一、工程款的认定

1. 实际履行证据
   即使没有书面合同，若能证明双方存在事实上的工程承包关系（如施工记录、验收单、结算单、付款凭证、往来函件、会议纪要等），法院或仲裁机构可能依据《民法典》第490条“法律、行政法规规定或者当事人约定采用书面形式订立合同，当事人未采用书面形式但一方已经履行主要义务，对方接受的，该合同成立”的规定，认定工程款金额。
   关键点：需提供证据证明工程量、单价、已付款等核心条款，例如：

   • 施工日志、监理签字文件；
     
   • 业主或发包方确认的工程量清单；
     
   • 第三方审计报告或造价鉴定意见。

2. 参照行业惯例或定额标准
   若双方对计价方式无明确约定，可依据《建设工程价款结算暂行办法》等规定，参照当地建设行政主管部门发布的计价方法或定额标准计算工程款。
   注意：需排除“口头约定明显低于市场价”的情形，避免显失公平。

3. 优先受偿权保护
   根据《民法典》第807条，承包人（即使无合同）对建设工程价款享有优先受偿权，但需在法定期限内（通常为竣工后18个月）主张，并需证明实际施工人身份。

二、农民工工资的认定

1. 劳动关系或劳务关系证明

   • 劳动关系：若农民工与用人单位（如包工头挂靠的公司）存在劳动关系，可依据《劳动合同法》主张工资，证据包括工牌、工资条、考勤记录、工作证等。
     
   • 劳务关系：若为个人提供劳务，需证明劳务内容、时间、报酬标准（如证人证言、录音、微信聊天记录等）。

2. “举证责任倒置”原则
   根据《保障农民工工资支付条例》，用人单位（包括总包单位、分包单位）需对工资支付情况承担举证责任。若用人单位无法提供工资发放记录，法院可能直接采信农民工主张的金额。

3. 行政干预与司法保障

   • 劳动监察投诉：向当地劳动保障监察部门举报，由行政部门责令支付；
     
   • 司法确认：通过调解组织达成协议后，申请法院司法确认，赋予强制执行力；
     
   • 刑事追责：若用人单位拒不支付劳动报酬，可能涉嫌《刑法》第276条之一的“拒不支付劳动报酬罪”。

三、实务建议

1. 收集证据是核心：优先固定书面证据（如结算单、付款承诺书），若无书面材料，可通过录音、录像、证人证言等方式补强；
   
2. 及时主张权利：工程款优先受偿权有期限限制，农民工工资主张需避免超过诉讼时效（3年）；
   
3. 联合维权：农民工可推选代表与用人单位协商，或通过工会、行业协会介入调解；
   
4. 申请财产保全：为防止转移资产，可向法院申请冻结发包方或承包人的账户、房产等。

提示：具体案件需结合证据链完整性、对方抗辩理由等综合分析，建议携带材料面谈，以便制定针对性策略。