施工单位在审计按点到点计算规则下，若合同与实际工程量相差很大，确实有权起诉，但能否胜诉需视具体情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同与实际工程量相差很大的法律性质
合同变更或解除的可能性：
- 如果合同中明确约定了工程量的计算方式和标准，而实际工程量与合同约定存在显著差异，这可能构成合同变更或解除的法定事由。根据《民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。若差异显著到影响合同目的实现，施工单位甚至可以主张解除合同。
审计规则的合理性：
- 审计按点到点计算规则本身并非法律强制性规定，而是合同双方约定的计算方式。如果该规则在合同中明确且合法，双方应遵守。但如果该规则存在不合理之处，如过于僵化、无法反映实际工程量等，施工单位可以在诉讼中提出异议，要求法院或仲裁机构根据实际情况进行调整。
二、施工单位起诉的法律依据
《民法典》合同编：
- 施工单位可以依据《民法典》合同编的相关规定，主张合同对方（如建设单位）存在违约行为，要求其承担违约责任。这包括要求支付因工程量差异导致的额外费用、赔偿损失等。
《民事诉讼法》：
- 施工单位有权根据《民事诉讼法》的规定，向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求法院对合同纠纷进行审理并作出判决。
三、施工单位起诉的注意事项
证据收集：
- 施工单位在起诉前应充分收集证据，包括合同文本、实际工程量记录、审计报告、沟通记录等，以证明合同与实际工程量存在显著差异，以及该差异是由对方原因造成的。
诉讼策略：
- 施工单位应根据具体情况制定合适的诉讼策略，如选择主张合同变更、解除还是要求对方承担违约责任等。同时，应考虑诉讼成本、时间成本等因素，做出明智的决策。
专业律师协助：
- 由于合同纠纷涉及复杂的法律问题和证据规则，施工单位在起诉前应咨询专业律师的意见，以确保诉讼策略的合理性和有效性。
四、可能面临的法律后果
胜诉：
- 如果施工单位能够提供充分证据证明合同与实际工程量存在显著差异，且该差异是由对方原因造成的，法院或仲裁机构可能会支持施工单位的诉讼请求，要求对方承担违约责任或进行合同调整。
败诉：
- 如果施工单位无法提供充分证据或证据不足以证明其主张，法院或仲裁机构可能会驳回施工单位的诉讼请求，施工单位需承担败诉的法律后果。
建议：施工单位在面临审计按点到点计算规则下合同与实际工程量相差很大的情况时，应首先与对方进行沟通协商，尝试通过友好方式解决纠纷。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。在此过程中，务必保持冷静、理性，并咨询专业律师的意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。