建设工程正在审计中，是可以起诉的。不过，是否起诉以及起诉的时机和策略，需要结合具体情况来综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律背景与原则
在建设工程领域，审计通常是对工程价款、工程质量、工期等方面进行的一种事后审查活动。审计本身并不影响当事人之间已经形成的法律关系，也不妨碍当事人通过法律途径解决争议。根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规，当事人有权在合法权益受到侵害时，向人民法院提起诉讼，寻求法律保护。
二、审计与诉讼的关系
审计不影响诉讼权利：审计是对工程事实的一种确认方式，但它并不决定当事人是否享有诉讼权利。无论审计是否完成，当事人都有权就争议事项向法院提起诉讼。
诉讼可能影响审计进程：如果一方在审计过程中提起诉讼，可能会对审计的进程产生一定影响。例如，法院可能要求暂停审计，以便对争议事项进行审理。但这并不意味着诉讼会阻止审计的进行，而是需要根据具体情况由法院或相关机构进行协调。
三、起诉的时机与策略
审计前起诉：如果当事人认为审计可能无法公正、客观地反映工程实际情况，或者担心审计结果对自己不利，可以在审计前提起诉讼。这种情况下，诉讼将作为解决争议的主要途径，而审计可能作为辅助证据或参考。
审计中起诉：在审计过程中，如果当事人发现审计存在明显错误、遗漏或不当行为，且这些错误、遗漏或不当行为可能影响审计结果的公正性和客观性，可以及时提起诉讼。通过诉讼，可以要求法院对审计过程进行监督，确保审计的公正性和客观性。
审计后起诉：如果审计已经完成，但当事人对审计结果不满意，认为审计结果侵犯了自己的合法权益，也可以在审计后提起诉讼。在这种情况下，诉讼将作为对审计结果进行复核和纠正的重要途径。
四、法律建议
充分准备证据：无论选择何时起诉，当事人都应充分准备相关证据，以支持自己的诉讼请求。这包括工程合同、施工记录、验收报告、审计报告等。
咨询专业律师：在起诉前，建议当事人咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及诉讼的可能结果和风险。律师可以根据当事人的具体情况，提供针对性的法律建议和诉讼策略。
考虑诉讼成本：诉讼需要投入一定的时间、精力和金钱。当事人在决定起诉前，应充分考虑诉讼成本，包括律师费、诉讼费、鉴定费等，并评估自己的经济承受能力。
如果你在建设工程领域遇到法律问题，或者对审计与诉讼的关系有进一步疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议和解决方案。