检察院对虚开发票案件的处理通常包括审查起诉、提起公诉或作出不起诉决定，具体流程和结果取决于案件事实、证据及犯罪情节等因素。以下是详细分析：

1. 审查起诉阶段
   检察院在收到公安机关移送的虚开发票案件后，会首先进行证据审查，包括发票真伪、资金流向、交易真实性等。若证据不足，可能退回补充侦查（最多两次）；若证据充分且构成犯罪，将依法提起公诉。
   关键点：检察院需确认虚开发票行为是否符合《刑法》第205条之一的规定（如虚开税款数额、情节严重程度等）。

2. 提起公诉的情形
   若虚开发票行为满足以下条件，检察院将向法院提起公诉：

   • 虚开税款数额较大（通常为1万元以上）或造成国家税款损失；
     
   • 存在主观故意（如为骗取出口退税、抵扣税款等）；
     
   • 具备完整的犯罪链条（如开具、接受、介绍虚开发票等行为）。
     结果：法院将根据《刑法》判处有期徒刑、拘役或罚金，情节特别严重的可能面临更高刑罚。

3. 不起诉决定的情形
   若符合以下条件，检察院可能作出不起诉决定：

   • 犯罪情节轻微（如虚开金额较小、未造成税款损失）；
     存在法定从轻情节（如自首、立功、认罪认罚）；
     证据不足或存在程序违法（如非法取证）。
     例外：若虚开发票行为同时涉及其他犯罪（如贪污、洗钱），可能以其他罪名追究责任。

4. 量刑建议的考量因素
   检察院在提起公诉时，会结合以下因素提出量刑建议：

   • 虚开税款数额及占比；
     
   • 犯罪次数及持续时间；
     
   • 是否退缴违法所得、补缴税款；
     
   • 是否存在主观恶性（如多次作案、组织策划）。
     示例：虚开税款数额较大且拒不认罪的，可能建议判处3年以下有期徒刑；数额巨大且有前科的，可能建议3-10年有期徒刑。

5. 企业涉案的特殊处理
   若虚开发票行为由单位实施，检察院将区分单位犯罪与个人犯罪：

   • 单位犯罪的，对单位判处罚金，对直接负责的主管人员和其他责任人员追究刑事责任；
     
   • 个人为谋取非法利益私自虚开的，仅追究个人责任。
     提示：企业若能主动配合调查、整改合规，可能获得从宽处理。

建议：若您或您的企业涉及虚开发票问题，需立即停止违法行为，并尽快委托律师介入。律师可协助梳理证据、争取不起诉或缓刑，并指导企业完善税务合规制度，降低后续风险。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我将结合事实与法律提供针对性方案。