离职体检查出乙肝，一般情况下不会扣工资。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国就业促进法》等相关法律法规，劳动者享有平等就业和选择职业的权利，不因民族、种族、性别、宗教信仰、健康状况等不同而受歧视。乙肝病毒携带者，只要其身体状况不影响正常工作，用人单位不得因其携带乙肝病毒而解除劳动合同或采取其他歧视性措施，包括扣减工资。
实际操作角度
体检目的与结果处理：离职体检通常是为了了解劳动者离职时的健康状况，以便用人单位做好工作交接和后续安排。体检结果，包括是否携带乙肝病毒，应当严格保密，仅用于医疗目的，不得作为歧视或扣减工资的依据。
工资扣减的合法情形：根据法律规定，用人单位只有在劳动者存在过错，如违反规章制度、造成经济损失等情况下，才能依法扣减工资。而携带乙肝病毒并不属于这些合法情形之一。
特殊情况说明
尽管一般情况下离职体检查出乙肝不会扣工资，但也存在一些特殊情况需要注意：
如果乙肝病情严重到影响工作：如果劳动者的乙肝病情严重到无法继续履行工作职责，且经过医疗鉴定确认，用人单位可能需要根据相关法律法规和劳动合同约定，与劳动者协商解除劳动合同或调整工作岗位。但即便如此，扣减工资仍然不是合法手段，用人单位应当通过合法途径解决。
用人单位违法操作：如果用人单位无视法律规定，以劳动者携带乙肝病毒为由扣减工资或采取其他歧视性措施，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
建议与措施
保留证据：如果遭遇用人单位以乙肝为由扣减工资的情况，劳动者应当保留好相关证据，如体检报告、工资条、劳动合同等，以便后续维权。
及时咨询：如有任何疑问或遭遇不公待遇，建议直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，离职体检查出乙肝一般不会扣工资。用人单位应当遵守法律法规，尊重劳动者的平等就业权利，不得因劳动者携带乙肝病毒而采取歧视性措施。