公司体检肝有问题通常不会被合法辞退。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律保障：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律规定，企业不能因为员工患病就立即解除劳动关系。若公司违反规定解雇患病员工，必须支付两倍的经济补偿金作为赔偿金。
   • 《中华人民共和国就业促进法》也明确禁止用人单位以传染病病原携带者为由拒绝录用，除非该员工的病情可能影响其本职工作，且公司有合理的证据证明，经过调整岗位后仍无法胜任工作，否则不能单纯以患病为由解雇员工。

2. 合法辞退的情况：

   • 若员工的肝病严重到无法履行工作职责，且公司经过合理调岗后仍无法安排其从事其他工作，此时公司可以依法解除劳动合同，但需提前通知或支付经济补偿。
   • 如果员工在试用期内被查出患有肝病，且该疾病不符合公司招聘时的健康要求，公司可以在试用期内解除劳动合同，但这需要在招聘时已将健康状况作为明确的录用条件。

3. 员工权益保护：

   • 员工若因肝病被公司不合理辞退，可以依法维护自己的权益。首先，可以尝试与企业管理层沟通，解释肝病在工作环境中不会传播，争取让企业改变决定。
   • 如果沟通无果，员工可以向劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助，通过法律途径要求公司恢复劳动关系，并对因辞退造成的损失进行赔偿。

综上所述，公司体检发现员工肝有问题，通常不能作为合法辞退的理由。员工在面临此类情况时，应了解自己的法律权益，并勇于维护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。