结论：劳动合同未做满合同期被扣3天工资的行为，通常是不合法的，但具体还需根据劳动合同中的相关条款以及实际情况来判断。以下从多个角度进行分析：
一、从劳动合同法的角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位不得无故克扣。如果劳动合同中没有明确约定未做满合同期需要扣工资，或者该约定违反了法律法规的强制性规定，那么用人单位扣工资的行为就是违法的。
举例：假设小张与某公司签订了一份为期一年的劳动合同，合同中并未约定未做满合同期需要扣工资。然而，在小张工作半年后提出离职时，公司却以未做满合同期为由扣除了他3天的工资。这种情况下，公司的行为就是违法的，因为劳动合同中没有相关约定，且该约定也不符合法律法规的规定。
二、从实际履行情况的角度
即使劳动合同中有关于未做满合同期扣工资的约定，也需要考虑该约定是否合理以及实际履行情况。如果用人单位扣工资的数额过高，或者扣工资的原因与劳动者的工作表现、行为等无关，那么该约定可能被视为不合理，从而不具备法律效力。
举例：小李与某公司签订了一份劳动合同，其中约定如果未做满合同期，将扣除相当于3天工资的违约金。然而，在小李因家庭原因提前离职时，公司却扣除了他相当于10天工资的违约金。这种情况下，公司的行为就是不合法的，因为扣工资的数额过高，且与实际约定不符。
三、从劳动者权益保护的角度
劳动者在劳动合同关系中处于相对弱势的地位，因此法律法规对劳动者的权益保护给予了特别的关注。如果用人单位以未做满合同期为由扣工资，且该行为没有合法依据，那么劳动者有权向劳动监察部门投诉或者提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：
审查劳动合同：首先，劳动者应仔细审查自己的劳动合同，看其中是否有关于未做满合同期扣工资的约定。如果没有约定或者约定不合法，那么用人单位扣工资的行为就是违法的。
与用人单位协商：如果劳动合同中有相关约定，但劳动者认为该约定不合理或者用人单位扣工资的数额过高，可以尝试与用人单位进行协商，寻求合理的解决方案。
寻求法律援助：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或者提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在必要时，也可以寻求专业律师的帮助。
可能后果：如果用人单位违法扣工资，除了需要返还被扣的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚以及劳动者的民事赔偿请求。因此，用人单位应严格遵守法律法规的规定，不得无故克扣劳动者的工资。
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