结论前置：公司制度规定国企女高管50岁退休是否合法，需根据具体情况判断。一般情况下，女干部（包括女高管）需年满55周岁退休，但也存在特殊情况可能允许提前退休。
一、一般情况下的退休年龄规定
女工人退休条件：
- 根据《国务院关于工人退休、退职的暂行办法》（国发〔1978〕104号），全民所有制企业、事业单位和党政机关、群众团体的女工人，年满50周岁且连续工龄满十年的，应该退休。但这一规定主要针对的是女工人，而非女干部或女高管。
女干部退休条件：
- 同样根据上述暂行办法及后续相关通知，企业中的女干部（包括女高管）一般需年满55周岁退休，且参加革命工作年限（即工龄）需满足相应要求。因此，如果公司制度直接规定女高管50岁退休，且未考虑其干部身份及工龄等因素，这一规定可能不合法。
二、特殊情况下的退休年龄规定
尽管一般情况下女干部需年满55周岁退休，但也存在多种特殊情况可能允许提前退休：
因病或非因工致残：
- 如果女高管年满45周岁，连续工龄满十年，且由医院证明并经劳动鉴定委员会确认完全丧失劳动能力的，可以提前退休。
从事特殊工种：
- 如果女高管从事井下、高空、高温、特别繁重体力劳动或其他有害身体健康的工作，且年满45周岁、连续工龄满十年的，也可以提前退休。不过，这一规定通常更适用于一线工人，女高管从事此类工作的可能性相对较小。
其他特殊情况：
- 某些地区或行业可能有特定的退休政策，允许女高管在特定条件下提前退休。这需要根据当地的具体政策来判断。
三、对公司制度合法性的分析
- 如果公司制度未考虑女高管的干部身份及工龄等因素，直接规定其50岁退休：这一规定可能违反了国家关于女干部退休年龄的一般规定，因此可能不合法。
- 如果公司制度在规定女高管退休年龄时，充分考虑了其干部身份、工龄以及可能的特殊情况：并且这些规定与国家法律法规及地方政策相符，那么这一制度可能是合法的。
四、建议与总结
- 建议：对于不确定自己是否符合退休条件的女高管，建议及时咨询当地的社保部门或向我这样的专业律师咨询，以获取最准确的解答和指导。
- 总结：公司制度规定国企女高管50岁退休是否合法，需根据具体情况判断。在一般情况下，女干部需年满55周岁退休；但在特殊情况下，如因病或非因工致残、从事特殊工种等，可能允许提前退休。因此，公司制度在规定退休年龄时，应充分考虑这些因素，并确保与国家法律法规及地方政策相符。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。