通过中介进厂的全日制员工加班费计算方式与普通全日制员工一致，主要依据加班时长和工资基数，按照法定标准计算。具体分析如下：

1. 加班费的计算基数
   加班费的计算基数通常是员工本人正常工作时间工资（即劳动合同约定的基本工资，不含奖金、津贴等）。若劳动合同未明确约定，则以实际发放的工资中固定部分作为基数（需扣除非常规性奖金、福利等）。
   例如：若月基本工资为5000元，则平日加班费基数为5000元，休息日或法定节假日加班同样以此为基数。

2. 加班费的计算标准
   根据《劳动法》第四十四条，加班费分三种情形：

   • 平日加班（超过8小时部分）：支付不低于工资的150%；
     
   • 休息日加班（如周末）：若未安排补休，支付不低于工资的200%；
     
   • 法定节假日加班（如春节、国庆）：支付不低于工资的300%。
     例如：若基本工资5000元，平日加班2小时，加班费为：5000÷21.75÷8×2×150%≈86.2元；休息日加班1天（8小时），加班费为：5000÷21.75×8×200%≈367.8元。

3. 通过中介进厂的特殊性
   中介的介入不影响加班费计算标准，但需注意：

   • 劳动合同签订主体：若与工厂直接签合同，工厂为责任主体；若与中介签劳务合同（非劳动关系），则可能不适用《劳动法》加班费规定（需按合同约定或《民法典》处理）。
     
   • 工资支付主体：工厂直接支付工资的，由工厂承担加班费；若工资由中介代发，需确认中介是否克扣（若克扣，可同时追究工厂和中介责任）。
     建议：入职前确认合同性质（劳动关系或劳务关系），并保留工资条、考勤记录等证据。

4. 维权途径
   若工厂或中介未依法支付加班费，可采取以下措施：

   • 协商：与工厂或中介沟通，要求补发；
     
   • 投诉：向当地劳动监察大队举报（电话12333）；
     
   • 仲裁/诉讼：申请劳动仲裁（劳动关系）或直接起诉（劳务关系）。
     

总结：加班费计算核心是“基数+时长+倍数”，中介不影响法定标准，但需警惕合同性质和工资支付主体问题。如有疑问，可直接向我咨询具体案例。