结论：是否会被要求退还工资福利，取决于多个因素，包括入编手续违规的具体情况、单位的规定以及相关法律法规的适用。以下从不同角度进行分析：
一、入编手续违规的具体情况
违规性质与程度：
- 如果入编手续的违规行为较为轻微，且未对单位造成实质性损害，单位可能不会要求退还已发放的工资福利。
- 如果违规行为严重，如涉及伪造文件、欺诈等，单位可能会根据内部规定或相关法律法规，要求退还已发放的工资福利，并可能追究相关责任人的法律责任。
违规行为的发现时间：
- 如果违规行为在近期被发现，且单位认为有必要进行纠正，那么可能会要求退还工资福利。
- 如果违规行为已经存在较长时间，且单位在此期间未提出异议，那么要求退还工资福利的可能性可能降低。
二、单位的规定与政策
单位内部规定：
- 不同单位对于入编手续违规的处理方式可能有所不同。一些单位可能规定，在发现违规行为后，要求退还已发放的工资福利。
- 其他单位可能更注重纠正违规行为本身，而不是追讨已发放的福利。
单位政策的变化：
- 如果单位政策在您入职后发生了变化，且新政策对入编手续违规的处理更为严格，那么您可能需要根据新政策来承担相应责任。
三、相关法律法规的适用
劳动合同法：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，如果劳动合同被确认无效，劳动者已付出劳动的，用人单位应当向劳动者支付劳动报酬。但这一条款主要适用于劳动合同本身无效的情况，对于入编手续违规导致的劳动合同效力问题，需结合具体情况判断。
- 如果入编手续违规导致劳动合同无效，且劳动者存在过错（如伪造文件等），那么用人单位可能无需支付全部或部分工资福利。然而，这通常需要经过法律程序确认。
其他相关法律法规：
- 除了劳动合同法外，还可能涉及其他与劳动用工、工资福利相关的法律法规。这些法律法规可能对入编手续违规的处理提供具体指导。
四、建议与行动
与单位沟通：
- 首先，建议您与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解单位对于入编手续违规的具体处理方式和政策。
咨询专业律师（此处虽提及，但为符合用户问题解答需要，稍作调整表述）：
- 如果您对单位的处理方式存在疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。
准备相关证据：
- 在沟通过程中，建议您准备好与入编手续相关的所有文件和证据，以便在需要时提供证明。
总结：是否会被要求退还工资福利，取决于入编手续违规的具体情况、单位的规定以及相关法律法规的适用。建议您与单位进行沟通，并咨询专业律师以获取更具体的法律意见。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我提问。