结论：在分包方已结清款项但小包工头未支付人工机械费的情况下，起诉的对象取决于具体的法律关系和合同约定，一般可能涉及起诉小包工头，若分包方存在过错也可能被起诉，同时若存在违法分包转包情形，总承包方或建设单位也可能被追责。以下是对此问题的详细分析：
起诉小包工头：
- 法律关系：小包工头与提供劳务或机械的一方（如工人、机械出租方）之间通常存在直接的合同关系或雇佣关系。如果小包工头未按照约定支付费用，提供劳务或机械的一方有权直接起诉小包工头，要求其支付拖欠的费用。
- 证据要求：起诉时，需要提供与小包工头之间的合同、欠条、工作记录、机械使用记录等证据，以证明小包工头确实拖欠了费用。
起诉分包方（在特定情况下）：
- 法律关系：如果分包方在与小包工头的合同中明确约定了分包方对小包工头支付费用的连带责任，或者分包方在支付过程中存在过错（如未按时支付、支付金额不足等），导致小包工头无法支付费用，那么提供劳务或机械的一方也可能有权起诉分包方。
- 证据要求：起诉分包方时，需要提供分包方与小包工头之间的合同、分包方的支付记录、小包工头的欠条等证据，以证明分包方存在过错或应承担连带责任。
起诉总承包方或建设单位（在违法分包转包的情况下）：
- 法律关系：如果分包方本身不具备相应的资质或未经允许进行分包转包，导致合同无效，且总承包方或建设单位对此存在过错（如明知分包方无资质仍与其签订合同），那么提供劳务或机械的一方在无法从小包工头或分包方处获得赔偿时，可能有权起诉总承包方或建设单位。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，违法分包转包导致合同无效的，总承包方或建设单位可能需承担一定的赔偿责任。
- 证据要求：起诉总承包方或建设单位时，需要提供分包方无资质的证据、违法分包转包的证据、总承包方或建设单位存在过错的证据等。
建议：
- 在起诉前，应尽可能收集充分的证据，以证明自己的主张。
- 如果对法律关系或证据要求不确定，建议咨询专业律师（即我本人，曾新律师，专注于合同纠纷、刑事辩护领域），以获取更具体的法律建议。
- 在起诉过程中，应遵循法律程序，确保自己的权益得到充分保障。